《Journal of Nanobiotechnology》:A smartphone-colorimetric dual-mode diagnosis method for breast cancer detection of BRCA-1 gene base on silver plated substrate and catalytic hairpin assembly amplification
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为解决乳腺癌早期诊断难题,研究人员开展基于镀银底物(SPS)和催化发夹组装(CHA)的 BRCA-1 基因检测研究。结果显示该方法检测限低至 0.6 pM,在实际样本分析中表现出色,对早期乳腺癌诊断意义重大。
在当今社会,乳腺癌已然成为女性健康的一大 “劲敌”。随着社会的快速发展,乳腺癌的发病率逐年攀升,且发病年龄越来越趋于年轻化。据 2020 年的数据显示,乳腺癌占所有癌症诊断的 11.7%(220 万例) 。由于早期诊断方法的限制,约 75% 的患者在晚期才被确诊,生存率仅 15%;而早期乳腺癌患者的生存率却高达 78% 。由此可见,早期检测、诊断和治疗对于乳腺癌患者至关重要。
循环游离 DNA(cfDNA)作为潜在的癌症早期诊断生物标志物,受到了广泛关注。其中,乳腺癌基因 1(BRCA-1)是乳腺癌重要的 cfDNA 之一,其突变显著增加乳腺癌风险,尤其是早发性和三阴性乳腺癌,对患者预后影响重大 。因此,检测和管理 BRCA-1 突变对乳腺癌高危人群的早期诊断和个性化治疗意义非凡。
然而,目前检测 BRCA-1 的 “金标准” 定量聚合酶链反应(qPCR)存在诸多弊端,如耗时久、对专业人员要求高,这限制了其实际应用和临床诊断性能 。近年来,虽然也有一些敏感、便捷的检测方法问世,但均存在一定缺陷,比如基于等温核酸扩增技术的比色生物传感器存在背景泄漏等问题,传统异质体系则成本高、操作复杂 。
为了解决这些问题,广东医科大学附属湛江中心医院的研究人员开展了一项研究。他们成功设计出一种基于 G - 四链体 DNAzyme(G4 DNAzyme)的无标记、无酶可视化检测 BRCA-1 的异质体系,并将其与智能手机辅助分析相结合 。
研究人员在此次研究中主要运用了以下关键技术方法:首先是利用镀银底物(SPS),通过 Ag-S 相互作用将 H1 固定在其表面;其次是催化发夹组装(CHA)技术,BRCA-1 基因可引发 CHA 循环;最后,利用 G4 /Hemin DNAzyme 的类过氧化物酶活性,加入 ABTS 和 H2 O2 实现多信号输出 。在检测过程中,还涉及到样本处理、多聚 acrylamide 凝胶电泳(PAGE)、比色测定等操作。
研究结果如下:
检测原理验证 :在 BRCA-1 存在时,H1 发夹结构打开,与 H2 结合引发 CHA 循环,生成大量 H1-H2 双链复合物,释放 G4 序列,加入 Hemin 后形成 G4 /Hemin DNAzyme 。通过异质分离技术去除未反应溶液,加入 ABTS 和 H2 O2 后可实现多信号输出,包括视觉比色检测、智能手机辅助 RGB 值检测和 UV 吸光度测量 。
可行性评估 :实验表明,SPS 相分离技术能显著降低背景干扰,同时保持高灵敏度。PAGE 分析显示,BRCA-1 可触发 CHA 反应,且 DNA 修饰后的 SPS 亲水性显著增加,证明 SPS-H1 制备成功 。
实验参数优化 :研究发现,最佳反应温度为 25℃,最佳 CHA 反应时间为 120 min,H1 最佳修饰水平为 1 μM,H1/H2 最佳比例为 1:2 。
方法灵敏度 :该方法检测限低至 0.6 pM,在 1 - 50 pM 范围内,吸光度与目标浓度呈良好线性关系(A = 0.09C + 0.205,R2 = 0.99) 。通过智能手机检测 RGB 值,在 0 - 100 pM 范围内,G/R 比与目标浓度也呈线性关系(Y = 0.00773C + 0.96929,R2 = 0.999),检测限为 4.6 pM 。
特异性分析 :碱基错配研究表明,该方法对目标 DNA 具有高特异性,且系统在 - 4℃下 5 天内保持高灵敏度 。
人血清样本检测 :在 5% 血清样本中检测 BRCA-1 的实验显示,该方法能有效区分癌组织和健康组织样本,受试者工作特征曲线下面积(AUC)为 0.9825 。与 qPCR 的对照实验表明,该方法在检测灵敏度、特异性和实际样本分析方面与 qPCR 相当,但操作更简单、成本更低 。
综上所述,该研究开发的无酶 BRCA-1 检测传感器,利用 CHA 信号放大结合 G4 DNAzyme,无需昂贵的荧光团、猝灭剂或酶修饰 。SPS 的使用有效消除了基质干扰,显著降低背景信号,提高了检测灵敏度 。该方法特异性强、灵敏度高,在实际样本分析中表现出色,为大规模无创乳腺癌筛查和早期诊断提供了一种经济有效的新途径,有望在临床实践中得到广泛应用,为乳腺癌的防治带来新的希望。
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