兰花中 RECG1基因新内含子起源探秘：为基因演化研究与复杂基因注释点亮新光

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《Journal of Molecular Evolution》：De Novo Creation of Two Novel Spliceosomal Introns of RECG1 by Intronization of Formerly Exonic Sequences in Orchidaceae

【字体：大中小】 时间：2025年04月10日 来源：Journal of Molecular Evolution 2

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　　为探究新剪接体内含子（spliceosomal introns）的起源与机制，研究人员对 49 种陆地植物的 RECG₁基因展开研究。发现天麻属（Gastrodia）和舌唇兰属（Platanthera）的 RECG₁基因第 4 内含子是新获得的，源于外显子内含子化。该研究有助于理解兰花基因进化及复杂基因注释。

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　　剪接体内含子是真核生物基因的关键特征。然而，新剪接体内含子的起源和机制仍不明确，记录内含子产生的明确案例研究也很有限。本研究检测了 49 种陆地植物的 RECG₁

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基因，其中包括 21 种兰花和 28 种非兰科植物。序列比较显示，天麻属（Gastrodia）和舌唇兰属（Platanthera）（兰科植物）的第 4 内含子是新获得的剪接体内含子，起源于以前的外显子序列的内含子化。这种内含子化事件伴随着新的可识别的 GT/AG 剪接位点的产生。相比之下，其他兰花物种在对应区域缺乏相应的剪接位点。此外，蛋白质的二级和三级结构表明，内含子化事件不会影响蛋白质的功能。鉴于这两个属的营养模式多样，我们推测选择压力的放松可能导致了基因结构的灵活性。本研究提供了一个通过内含子化在兰花中从头产生特定谱系内含子的典型例子，且这两个内含子化事件在同一基因中独立发生。该研究增进了我们对兰花基因进化的理解，并为注释结构复杂的基因提供了有价值的见解。

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