《Scientific Reports》:Effects of hydroxypropyl starch on intestinal health and transcriptome of geese
编辑推荐:
为解决鹅尿酸代谢紊乱致痛风及经济损失问题,安徽科技学院研究人员开展羟丙基淀粉(HPS)对鹅肠道健康和转录组影响的研究。结果表明 HPS 可改善肠道形态、降低血清尿酸水平,为其作鹅饲料添加剂提供科学依据。
在鹅养殖产业中,痛风就像一个隐藏的 “经济杀手”,悄悄给养殖户带来巨大损失。这是因为尿酸代谢紊乱引发的痛风,严重影响了鹅的健康和生产性能。肠道作为尿酸代谢的重要器官,其健康状况对尿酸代谢起着关键作用。然而,传统的养殖方式和饲料配方,难以有效改善鹅的肠道健康和尿酸代谢问题。为了打破这一困境,探索提高鹅养殖效益的新途径,安徽科技学院的研究人员开展了一项意义重大的研究。他们聚焦于羟丙基淀粉(HPS)对鹅肠道健康和转录组的影响,致力于揭示其中的奥秘。最终,研究发现 HPS 能改善肠道形态,降低血清尿酸水平,这一成果为鹅饲料添加剂的开发提供了科学依据,有望为鹅养殖产业带来新的生机。该研究成果发表在《Scientific Reports》上。
研究人员主要运用了以下关键技术方法:选用 240 只 30 日龄扬州鹅,随机分为对照组(CG)、羟丙基淀粉组(HPS)和尿酸钠组(SU)进行分组饲养实验;采集血清和回肠样本,分别用于测定血清尿酸水平和进行组织学观察;提取回肠 RNA 构建文库测序,对测序数据进行转录组比对、组装及生物信息学分析;随机选取 6 个差异表达基因(DEGs)进行定量实时 PCR(RT-qPCR)验证 。
研究结果
- 血清尿酸水平:研究人员通过对不同处理组鹅血清尿酸水平的测定发现,SU 组血清尿酸水平最高,达 129.7μmol/L,显著高于其他两组;HPS 组血清尿酸水平为 56.6μmol/L,明显低于 CG 组的 70.8μmol/L。这表明 HPS 能有效降低鹅血清尿酸水平。
- 回肠组织学观察:对回肠进行组织学观察,结果显示 CG 组回肠绒毛排列紊乱,肠上皮细胞轮廓模糊;HPS 组回肠组织结构完整,绒毛排列有序;SU 组回肠绒毛受损,隐窝深度增加,肠绒毛上皮脱落。同时,HPS 组的绒毛高度(VH)显著高于 CG 组和 SU 组,隐窝深度(CD)显著低于 SU 组,绒毛高度与隐窝深度比值(VH/CD)显著高于 CG 组和 SU 组。这充分说明 HPS 对鹅回肠形态具有积极的保护和改善作用。
- 回肠转录组数据分析:构建 12 个鹅回肠转录组文库后,研究人员对测序数据进行了深入分析。主成分分析(PCA)显示不同处理组的回肠样本分布在不同亚群,表明筛选出的 DEGs 可靠。进一步分析发现,CG 与 HPS 组比较有 126 个 DEGs,CG 与 SU 组比较有 538 个 DEGs,HPS 与 SU 组比较有 1337 个 DEGs。
- 差异表达基因分析:对不同处理组的 DEGs 进行分析,发现 CG 与 HPS 组比较中,DEGs 主要富集在刷状缘膜、核糖体亚基等相关过程;CG 与 SU 组比较中,DEGs 主要富集在免疫反应等相关过程;HPS 与 SU 组比较中,DEGs 主要富集在核糖体、肠道免疫网络等相关过程。KEGG 富集分析表明,CG 与 HPS 组比较中,显著富集的通路是核糖体;CG 与 SU 组比较中,显著富集的通路包括 DNA 复制等;HPS 与 SU 组比较中,显著富集的通路有核糖体、肠道免疫网络等。
- 趋势分析:以 P<0.05 为筛选标准对 DEGs 进行趋势分析,发现三个显著基因表达谱(profiles 7、0 和 4),共包含 1171 个基因。其中 776 个基因在上调表达谱中,395 个基因在下调表达谱中。对这些基因进行功能富集分析,发现上调基因主要富集在核糖核蛋白复合物、免疫反应等相关过程,下调基因主要富集在与膜成分相关的过程。
- RT-qPCR 验证:随机选取 6 个基因进行 RT-qPCR 验证,结果显示这些基因的表达谱与 RNA-Seq 测序结果趋势相似,有力地证明了转录组测序结果的可靠性。
研究结论与讨论
综合研究结果可知,HPS 对鹅肠道形态和尿酸代谢具有显著的积极影响。从肠道形态方面来看,HPS 能增加绒毛高度,提高 VH/CD 比值,缓解高尿酸水平对肠道结构的损伤。这可能是因为 HPS 经肠道微生物发酵产生短链脂肪酸(SCFAs),SCFAs 不仅能为上皮细胞提供能量,促进尿酸代谢,还能维持肠道上皮屏障的完整性,促进有益菌生长。从尿酸代谢角度分析,HPS 可能通过上调与肠道功能、结构和尿酸代谢相关的基因表达,如 SLC5A12、SLC5A8、NR5A2、IPMK、PDZK1 等,增强肠道对营养物质的吸收和尿酸的排泄,从而降低血清尿酸水平。此外,研究还发现尿酸浓度升高会破坏肠道结构,引发炎症反应,刺激肠道免疫产生 IgA。而 HPS 可通过调节相关信号通路,如 PPAR 信号通路、PI3K-Akt 信号通路等,减轻炎症反应,维护肠道健康。
这项研究意义重大,它系统地揭示了 HPS 对鹅肠道健康和尿酸代谢的作用机制,为 HPS 作为鹅饲料添加剂的应用提供了坚实的理论基础。未来,研究人员可基于此,进一步利用基因编辑技术提高鹅对尿酸的耐受性,降低痛风发病率,提升鹅养殖产业的经济效益和可持续发展能力。
下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究
10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!
欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书
单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析
下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》