• Grouped-seq:可同时获取肿瘤类器官表型与表达谱信息的高通量分析平台技术

  2021年12月10日，清华大学医学院生物医学工程系刘鹏研究员课题组联合北京航空大学陈晓芳副教授课题组在学术期刊Nucleic Acids Research上在线发表题为Grouped-seq for integrated phenotypic and transcriptomic screening of patient-derived tumor organoids的研究论文，报道了能够高通量、低成本的从微量肿瘤类器官同时获得表型和对应表达谱变化的新技术。该平台为肿瘤类器官的高通量药物筛选提供了一个多元化的有力工具，让精准药物开发与测试成为可能。近年来，肿瘤类器官（Patient-deri

  来源：清华大学医学院

  时间：2021-12-16

• 研究人员开发新的3D打印技术来制造生物膜

          图片:研究生Ram Gona设计了一个3D生物打印机，它使用了一种由罗切斯特大学生物学教授Anne S. Meyer和她在荷兰代尔夫特理工大学的合作者开发的技术来创建生物膜。图片来源:罗切斯特大学/ J.亚当·范斯特罗切斯特大学(University of Rochester)生物学副教授安妮·s·梅耶(Anne S. Meyer)和她在荷兰代尔夫特理工大学(Delft University of Technology)的合作者最近开发了一种3D打印技术来设计和研究生物膜——附着在表面上的微生物(如细菌)的三维群落。这项研究为合成材

  来源：ACS Synthetic Biology

  时间：2021-12-16

• 中国科学院动物研究所近期取得生物3D/4D打印系列突破

  　　生物3D/4D打印技术是器官体外再造的重要手段。近年来，打印技术已在多种组织器官构建中有所应用，但是工程手段的单一性无法满足器官复杂性的需求，尤其缺少多尺度管道连接以及微环境动态变化控制的策略；另外制造器官中的细胞空间运动规律不明、调控手段缺失。针对以上问题中国科学院动物研究所交叉学科团队近期取得了以下系列成果。 　　（1）一体化复杂管网组织打印 　　中国科学院动物研究所顾奇、沈阳自动化研究所郑雄飞、化学研究所王树研究团队协同攻关、耗时4年建立了复合打印系统实现多尺度管道的功能连接。联合团队开发了低粘度双分子互穿网络水凝胶，并调节高分子网络孔径促进人脐静脉内皮细胞（HUVECs）形成毛细血

  来源：中国科学院动物研究所

  时间：2021-12-16

• Journal of Medicinal Chemistry：基于AI的新型蛋白-小分子打分方法

  在创新药物的研发过程中，先导化合物的发现是新药开发的关键，先导化合物的质量直接决定药物开发的成败。在筛选和设计先导化合物的过程中要充分考虑其生物活性、结构新颖性、靶点选择性、成药性和毒性等特性，其中化合物对靶标的生物活性是研究者最为关注的特性之一，但实验方法定量小分子对靶点的生物活性花费大、周期长，并不适用于化合物活性的高通量评价。基于分子对接的虚拟筛选成本低、效率高，已成为先导化合物发现的核心技术。在分子对接计算中，打分函数（SF）被用于评价受体-配体间相互作用的强弱。但分子对接所用的打分函数一般采用简单的线性拟合模型，精度往往不高，严重影响了虚拟筛选的预测能力。因此，开发高精度的打分函数是

  来源：浙江大学

  时间：2021-12-15

• 发现细胞表面分子组织的技术

  生物细胞具有多种功能，它们需要相互沟通来协调这些功能。细胞表面的分子是这个过程的中心。几十年来，生物学家一直在研究这种表面蛋白，越来越清楚的是，不仅它们的存在，而且它们在细胞表面的组织对细胞的功能至关重要。“蛋白质不是简单地均匀分布在细胞表面，彼此独立;相反，它们被组织成分子群落。在这些群体中，蛋白质通常一起工作来履行细胞功能，”苏黎世联邦理工学院转化医学研究所的Bernd Wollscheid教授解释说。Wollscheid的博士生Maik Müller与来自苏黎世联邦理工学院和其他机构的进一步研究人员组成的大型跨学科团队一起，现在已经开发出一种可以用来。“谁得到了一个吻?”通过这种名为LU

  来源：Nature Communications

  时间：2021-12-14

• 酮类饮食可能对女性不起作用——以下是效果更好的方法

     来自加州大学河滨分校(University of California, Riverside)的科学家们正在研究流行的生酮饮食和间歇性禁食在分子水平上是如何起作用的，以及是否两性都能从中受益。酮饮食背后的理念是低水平的碳水化合物和高水平的脂肪和蛋白质将迫使身体使用脂肪作为燃料，从而减轻体重。无数的人对它深信不疑，无数的公司生产为这些人设计的食品。间歇性禁食的原理与此类似，也就是把进食限制在一天中的一小段时间内。在几个小时不进食的情况下，身体消耗掉储存的糖分，转而燃烧脂肪。脂肪转化为酮体，供大脑用作燃料。尽管它们很受欢迎，科学家们还没有发现使这种饮食起作用的基因或蛋白质

  来源：scitechdaily health

  时间：2021-12-13

• 重点实验室在红球藻虾青素资源开发研究中取得重要理论和技术进展

  　　近日，重点实验室藻类与藻类生物技术团队在红球藻虾青素资源开发领域取得重要进展，发现无氧呼吸糖酵解（EMP）、有氧呼吸三羧酸循环（TCA）、戊糖磷酸途径（PPP）和线粒体呼吸交替氧化酶途径（AOX）等多种非光依赖型代谢途径都对红球藻虾青素的合成积累产生重要调节作用。相关理论成果以3篇研究论文在国际Top期刊生物资源工程技术类一区《Bioresource Technology》（IF=9.642）发表，衍生出的相关技术成果分别申报了4项国家发明专利，其中2项已获专利授权。 　　虾青素呈鲜红色，具有非常强的着色、抗氧化能力和多种生物学功能，在营养健康食品、医药保健和化妆品等领域都有广阔

  来源：中国科学院海洋研究所

  时间：2021-12-11

• “一种檀香高含量精油组织总RNA的提取方法”获发明专利

    　　12月10日获悉，由中科院华南植物园张新华等科研人员完成的“一种檀香高含量精油组织总RNA的提取方法”获国家发明专利授权。  　　取檀香木材组织液氮研磨成粉末后，加入到Tris-HCl提取液中，-80°冷冻处理，离心取上清，再加入醋酸钠和异丙醇沉淀RNA，离心后用TE缓冲液溶解沉淀，然后加入十六烷基三甲基溴化铵混匀，用氯仿/异戊醇抽提，离心，取上清，加入氯化锂过夜沉淀RNA，离心，用乙醇洗涤后，即得总RNA。利用该发明方法提取的檀香木材组织总RNA用Nanodrop检测的OD260/OD280的比值为2.0以上，OD260/OD230的比值为2.3以上，RNA水溶液

  来源：中国科学院华南植物园

  时间：2021-12-11

• 上海交大周培教授课题组在超富集植物龙葵响应镉胁迫方面取得重大突破

  近日，上海交通大学农业与生物学院周培教授团队在生态环境领域国际著名期刊Journal of Hazardous Materials（中科院一区 Top）在线发表了题为Comparative cytology combined with transcriptomic and metabolomic analyses of Solanum nigrum L. in response to Cd toxicity 的研究论文。研究利用植物细胞学、转录组学和代谢组学方法分析超富集植物龙葵对短期不同浓度镉（Cd）胁迫的响应变化，探讨了龙葵对C

  来源：上海交大 新闻学术网

  时间：2021-12-11

• 快100倍！新技术让我们掌握细胞更准确的“死亡时间”

          格莱斯顿的研究人员开发了一种新技术，可以更容易地研究导致细胞死亡的因素，包括神经退行性疾病。很难判断一个脑细胞何时死亡。在显微镜下表现为不活跃和碎片化的神经元可能会在数天内一直处于一种生死不决的状态，有些神经元在表现为惰性后突然开始再次发出信号。对于研究神经退行性变的研究人员来说，由于缺乏神经元的精确“死亡时间”声明，因此很难确定导致细胞死亡的因素，也很难筛选可能挽救衰老细胞死亡的药物。现在，格莱斯顿研究所的研究人员开发了一项新技术，可以让他们同时跟踪数千个细胞，并确定小组中任何细胞的精确死亡时刻。这种方法不仅适用于活斑马鱼，也适用

  来源：Science Advances

  时间：2021-12-10

• IMC技术助力乳腺癌精准治疗 从单细胞空间分析预测三阴性乳腺癌患者对新辅助免疫治疗的反应

  在2021年12月7日至10日举行的圣安东尼奥乳腺癌研讨会上，新一代技术—— imaging mass cytometry 成像型质谱流式细胞分析（IMC）受到格外关注。根据会议提交的报告，这种允许在单个细胞水平上研究蛋白表达以及在肿瘤微环境下细胞内定位的新一代技术，能够为早期高风险和局部晚期三阴性乳腺癌(TNBC)患者添加免疫检查点抑制剂阿替利珠单抗atezolizumab(Tecentriq)作为化疗的辅助治疗的受益情况提供有用的信息。“我们正在经历一场描述肿瘤分子复杂性的技术革命，”提交报告的米兰IRCCS圣拉菲尔Ospedale San Raffaele临床肿瘤科乳

  来源：生物通

  时间：2021-12-10

• 浙江大学最新发文：首次报道植物脱毒技术在植物-土壤-微生物互作反馈机制

  2021年12月9日，农学院毛碧增研究员课题组在《Industrial Crops and Products》杂志上在线发表了题为“Insight into the root growth, soil quality, and assembly of the root-associated microbiome in the virus-free Chrysanthemum morifolium”的研究论文。该成果在国内外首次报道植物脱毒是增强植物招募微生物群落过程的重要驱动力，在调控地下植物碳分配、恢复驯化植物与有益土壤微生物相互作用的能力、提高土壤功能和作物产量方面具有重大作用。植物病毒作

  来源：浙江大学农业生物技术学院

  时间：2021-12-10

• 从unmapped RNA-seq数据中调取全长序列的新方法

  　　11月27日，中国农业科学院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队在《BMC 基因组学（BMCGenomics）》杂志在线发表了题为“Baiting out a full length sequence from unmapped RNA-seq data”的学术论文，该研究发现了能挖掘unmapped RNA-seq数据中的有效信息，并调取其全长的新方法。转录组测序技术(RNA-seq)是生物学和医学研究必不可少的工具，每年约产生577万亿碱基对的数据集。然而，由于技术条件限制，如此庞大的数据量中约有10%-15%的unmapped数据被忽略。该研究通过严格的筛选流程，从RNA-s

  来源：中国农科院基因组所

  时间：2021-12-10

• 前所未有的以细胞分辨率拍摄植物图像的三维X射线显微镜方法

  “这篇论文关注的是多尺度，”通讯作者Chris Topp说，“因为植物是多尺度的。玉米穗最初是由一群叫做分生组织的微小细胞组成的。分生组织细胞通过分裂和生长最终形成玉米植株的所有可见部分。”他们改进的3D x射线显微镜(XRM)技术使研究人员能够将植物的发育微观结构(如分生组织细胞)与它们成熟时的可见特征(如叶子和花朵)联系起来。换句话说，3D XRM提供了整个植物器官和组织的细胞级分辨率。此外，他们的XRM方法还可以以极高的分辨率成像地下结构，包括根、真菌和其他微生物。“植物的根驱动着许多重要的生物过程;它们喂养土壤中的微生物，作为回报，植物得到磷和氮，”Topp解释说。“我们知道根和微生物

  来源：Donald Danforth Plant Science Center

  时间：2021-12-09

• 水生所在小球藻异养高密度培养技术上取得重要进展

  　　我国蛋白饲料资源尤其是饲用大豆和鱼粉原料的对外依存度高达80%以上，蛋白饲料资源短缺已成为限制我国饲料行业发展的主要因素之一。构建替代豆粕、鱼粉等蛋白源的生物资源持续利用体系已成为我国经济可持续发展的重要战略需求。  　　微藻来源的单细胞小球藻生长速度快，蛋白质含量高，氨基酸组成合理，是理想的战略蛋白源。近年来，小球藻作为可替代蛋白资源在人类食品和饲料领域正发挥着重要作用。目前，商业化小球藻生产主要采用光自养培养模式，该培养模式下较高的生产成本制约其作为替代蛋白源的开发。异养培养作为一种更为经济和高效的工业化生产模式，是降低小球藻生产成本、提升产能的有效途径。然而，受技术水平所

  来源：中国科学院水生生物研究所

  时间：2021-12-09

• 水生所在基于精准水位调控控制水库藻类水华技术上取得新进展

  　　水库的修建是人类开发利用和管理水资源的重要方式。水库在防洪、灌溉、供水、发电和航运等方面发挥着重要的作用。全球范围内，水库的蓄水量约占淡水湖泊的10%，却直接贡献了全球粮食产量的12~16%。随着全球人口增长对食品和电力的需求不断增加，全球范围内水库建设仍处于快速发展时期。然而由于水文情势的变化，水库修建往往会带来诸如富营养化和浮游植物水华等不利影响，从而降低其生态系统服务价值。  水位调控对藻类水华动态影响因果分析与建模 　　流水不腐，户枢不蠹。长期以来，直观的认知认为只要水流动起来，就能够改善水质。然而关于如何开展精准定量的水动力调控控制藻类水华改善水质的研究仍十分有限

  来源：中国科学院水生生物研究所

  时间：2021-12-09

• 桂建芳院士团队在新创期刊Water Biology and Security发表鱼类生物学和生物技术再思考的长文评述

  　　鱼类生物学的发展已有百年历史。随着基因组时代的到来以及对全球食品安全的需求，鱼类生物学和生物技术近十年来已取得更为重大的突破。这些突破不仅促进了重大理论创新，也为现代水产养殖产业和世界鱼类供给及粮食安全提供了坚实的技术支撑。  　　近日，中国科学院水生生物研究所桂建芳院士团队应新创期刊Water Biology and Security的创刊需求和国际前沿及发展趋势，发表了题为“在基因组资源快速增长和粮食安全日益强化的挑战时代鱼类生物学和生物技术再思考”的长文评述。该评述包括六个部分：1）重要鱼类谱系的生物学创新和基因组演化；2）天然多倍体鱼类的演化命运及结果；3）鱼类驯养和

  来源：中国科学院水生生物研究所

  时间：2021-12-09

• 华南植物园“一种异戊烯基查尔酮类化合物及其制备方法”获美国发明专利

    　　9月8日获悉，由中科院华南植物园杨宝、蒋跃明等科研人员完成的“一种异戊烯基查尔酮类化合物及其制备方法（ISOPENTENYL CHALCONE COMPOUND AND PREPARATION METHOD THEREOF）”获得美国发明专利授权。  　　该发明公开了一种制备2,2',4,4'-四羟基-3'-(2'',3''-二羟基-3''-甲基丁基)查尔酮的方法，该方法的步骤为：用体积分数40~100%甲醇或乙醇水溶液浸提桑叶，将浸提液浓缩去除甲醇或乙醇后用水溶解，然后依次用石油醚、乙酸乙酯萃取，将乙酸乙酯萃取液浓缩得浸膏，浸膏经硅胶柱层析，以氯仿/甲醇为洗脱剂，

  来源：中国科学院华南植物园

  时间：2021-12-09

• 华南植物园“一种香蕉保鲜剂和香蕉贮藏保鲜方法”获发明专利

    　　10月25日获悉，由中科院华南植物园蒋跃明等完成的“一种香蕉保鲜剂和香蕉贮藏保鲜方法”获国家发明专利授权（专利号：ZL201810291872.6）。  　　该发明通过实验发现，香蕉果实经过二氯异氰尿酸钠处理后，能有效的延缓香蕉的成熟，延长香蕉采后贮藏时间7到10天，贮藏28天后对照组和处理组的黄化指数分别为6.13和3.00，乙烯释放峰和呼吸跃变峰分别延迟8天和4天出现。按照该发明的方法对适时采收状态良好的绿熟香蕉果实进行保鲜处理，然后用聚乙烯薄膜袋包装，在25±2℃、相对湿度90±5%的条件下贮藏，能够有效延缓香蕉果实成熟和腐烂、保持较好的果实品质，果实贮藏20

  来源：中国科学院华南植物园

  时间：2021-12-09

• 华南植物园“一种二氢呋喃查尔酮类化合物及其制备方法”获美国发明专利

    　　11月23日获悉，由中科院华南植物园杨宝等科研人员完成的“一种二氢呋喃查尔酮类化合物及其制备方法”获美国发明专利授权。  　　该方法的步骤为：用体积分数40~100%甲醇或乙醇水溶液浸提桑叶，将浸提液浓缩去除甲醇或乙醇后用水溶解，然后依次用石油醚、乙酸乙酯萃取，将乙酸乙酯萃取液浓缩得浸膏，浸膏经硅胶柱层析，以氯仿/甲醇为洗脱剂，收集氯仿/甲醇体积比为95/5洗脱的馏分，该馏分再经反相柱层析，以乙腈/水为洗脱剂，收集乙腈/水体积比为30/70洗脱的馏分，即得二氢呋喃查尔酮。该发明对于推动桑叶的深加工利用，提升桑叶产品附加值，促进该行业的可持续发展具有重要的意义。 &n

  来源：中国科学院华南植物园

  时间：2021-12-09

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