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生物信息软件集成和开发
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:随着生物信息学在生命科学和生物技术研究开发中发挥出日益重要的作用,生物信息学常用软件已经成了生物学工作者必备工具。许多国际著名生物信息中心通过计算机网络提供数据库检索和数据库搜索等服务。1997年以来,在国内有关部门和欧洲分子生物学网络组织的支持和帮助下,以教育科研华北地区主节点为支撑,北京大学生物信息中心逐步建立了一套比较完备的生物信息服务系统,为国内及周边地区的用户提供生物信息学资源和综合服务,并在此基础上进行生物信息软件工具的集成和开发。他们建立的生物信息资源服务系统基于UNIX平台,包括数据库检索系统SRS、数据库下载服务FTP、以及数据库搜索系统
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唱歌的鹦鹉——干细胞移植——生物信息学
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:据中国科学院生物物理所陈润生教授4月11日在中国首届生物信息学大会上的报告:科学家研究发现将已经学会唱歌的鹦鹉中枢破坏后,注射从不会唱歌的鹦鹉提取出的神经干细胞,受损伤的的鹦鹉的歌唱中枢得到恢复,并且能够恢复歌唱能力。由此可说明干细胞进入异体后,可以按受体的信息修复、整合出受体中受损细胞的原始功能。研究者已经从成人的许多组织(如眼球、神经)中分离出与胚胎干细胞具有同样分化能力的多功能干细胞,这将使器官移植的概念逐渐被细胞移植所代替,同时也解决了的异体移植的排斥问题。现在的问题是并没有在人体的所有组织中找到干细胞,而且成人干细胞数量少,分离困难,培养分化所需
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四百多位专家共商我国生命科学未来
新华网消息 据《科技日报》4月12日报道(吴洁) 首届中国生物信息学大会在军事医学科学院召开。来自全国各地及海外的400多位著名专家、学者齐聚京城,还有近10位院士莅临盛会。会场座无虚席,连走道上都挤满了热切的听众。大会的议题包括:基因组研究、蛋白质结构模型模拟和预测、药物分子设计、生物信息学数据库、算法和软件的开发等。 这次大会是由国家人类基因组研究北方中心、南方中心、华大基因研究中心、军事医学科学院与北京市科委、北京
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国际减肥大会掀起仿生减肥热
中国经济时报消息:北京2001年国际减肥大会于4月12日在京召开,参展项目中除药物减肥、节食减肥、器械减肥等传统方法外,“开心瘦自然仿生减肥法”在会上备受青睐。 “开心瘦自然仿生减肥法”由中国保健科技学会自然仿生治疗研究会会长、著名仿生学专家张东志和该研究会的医学专家经过多年研究发明,并由北京开心瘦自然仿生减肥有限公司经营推广。 这项全新的减肥技术一改过去的传统观念,将仿生科学引入减肥领域,利用冬眠动物的脂肪分解机理,实现人体的健康瘦身。它以仿生呼吸为主,辅以仿生呼吸带的作用、仿生健康调理、生命营养醋的补充、仿生减肥操的形体运动、自然食疗的巩固等一整套减肥过程,在调理人体健康的过程中同
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人类基因组计划给海洋药物开发带来的启示
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:海洋蕴藏着丰富的生物资源,动物类群的32个门中就有31个门生活在海洋中。80年代以来,世界沿海各国开始非常重视海洋新药研究与开发,发展海洋药物已成为医药研究的一个热点领域。近年来,海洋药物的研究已取得了突破性的进展,已经引起了沿海各国政府的高度重视。我国是个海洋大国,蕴藏着丰富的海洋生物资源,具有多样性和地区特异性,以南海为例,就有海蛇、海葵、海胆、芋螺、水母、鲎等数百种含肽类毒素的生物品种,有着极大的学术研究价值和医药价值,这些生物资源的的开发已越来越受到科学家的重视并成为各国争夺的资源。 人类基因组计划为海洋药物的开发提供了新的研究方法和研究思路
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新世纪生物信息学
新生命网站全国首届生物信息学大会报道: 回顾与动态 生物信息学至今已有两大板块:一是基因组信息学;二是神经信息学(neuroinformatics)。这里仅谈及前者。 1995年Venter等人率先公布了第一个完整基因组序列(流感嗜血杆菌),最近他们又将31亿bp的人基因组序列测完,不久小鼠基因组测序和上百种微生物亦将完成。如此巨量的DNA序列信息将会深刻地改变着生物学与医药学,其中生物信息学起了不可取代的作用。 根据各方面的鉴定,尤其是国际GASP(基因组诠释评估计划)实验评估(取实验研究已达20多年的黑腹果蝇基因组的酒精脱氢酶区段作为验证的目标),至今生物信息学的采集信息与识别
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我国科学家构建民族多样性数据库
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:人类基因组计划的实施使生命科学的研究进入了一个飞速发展的新阶段,生物信息学也随之迅速兴起,并成为最活跃的的领域之一。我国于1994年开始进行人类基因组研究,科学家们充分发挥我国的资源优势,在基因组多样性、疾病相关基因和重要功能基因的研究方面取得了重要进展,并及时展开功能基因组和结构基因组的研究,争取在国际人类基因组研究中取得更大的成果。 在国家自然科学基金委员会重大项目“中华民族基因组的结构和功能研究”中,北京大学生物信息中心所承担的任务是配合DNA多态性研究工作构建数据库。受合作项目各科研组的支持,现已完成了中华民族基因多态性数据库(Polymor
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我国科学家建立并分析150天人胎脑海马cDNA数据库
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:学习与记忆是人类智能和其他高级精神活动的基础。学习与记忆机制的研究对揭示脑的奥秘、最终认识生命的本质有着重要的意义。相关神经机制的研究是当代神经生物学的一个热点课题。其中记忆过程中的关键结构——位于两侧大脑半球颞叶内表面的海马,正受到日益的关注。 胎儿海马发育与基因的表达与成人及病变的海马有着极为密切的联系,但是由于取材困难,鲜有相关报道。我国科学家在成功制备了150天人胎脑海马cDNA文库的基础上,通过大规模测序的方法,并且运用了当前计算机领域中关于数据库和网络的较新技术建立了一个150天人胎脑海马的cDNA序列数据库系统。其中测序总反应数超过10
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基因芯片相关生物信息学进展
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:基因芯片又称寡核苷酸芯片或DNA芯片,通过把大量的DNA片断以可寻址的方式,高密度地固定到一块指甲大小的玻璃片或硅片上,利用核酸碱基之间的配对,用来进行样品DNA高通量、并行的分析信息的工具。随着国际大规模的基因测序计划的爆炸性发展,人们已经把目光从单纯的测序转向进行基因功能研究的后基因组时代。面对浩如烟海的序列信息,DNA芯片以其并行、高通量的特点当之无愧的成为后基因组时代的首要研究工具。由于基因芯片的高集成性,每一次芯片实验都要产生巨大的信息量。以平均每片5000个点,每个实验设4个水平,每个水平重复3次计算,则一次完整的实验将产生6万个数据。如此
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后基因组时代的药物设计
新生命网站全国首届生物信息学大会报道:人类基因组及其它基因组测序工作的进行为新药研制提供了许多潜在的靶点。这些潜在的靶点一方面为制药业创造了前所未有的机会,另一方面也带来了严峻的考验。传统药物设计的出发点是单一的药物作用靶点,以此进行先导化合物的实验或计算机筛选。后基因组时代为我们提供了大量靶点的信息,同时这些信息又是不完整的,很多时候甚至对于靶点的结构和功能还不清楚。因此迫切需要发展能够适应这种要求的新的药物设计方法。 针对后基因组时代药物设计的需要,我国科学家已经建立了与人类疾病相关的蛋白质结构数据库(HDRPD),发展了能够快速进行小分子化合物与蛋白质结合部位匹配的方法 。HD
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降胆固醇新药可防早老性痴呆
新华网消息:德国海德堡大学的科学家新研制成功的降胆固醇药物,同时具有防治早老性痴呆的功能。 科学家们一直在研究与探讨脂肪、胆固醇与早老性痴呆之间究竟存在着什么样的关系。通过实验,几位研究人员得出结论认为,如果血液中的胆固醇含量高,就很容易引发早老性痴呆。 通过在豚鼠身上所做的实验,海德堡大学的科学家们研制成功两种降胆固醇新药,并发现它们能够降低引发早老性痴呆的贝塔-淀粉状蛋白质的含量。
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以信息系统的观点了解基因组
新生命网站消息:随着人类基因组计划的完成,后基因组时代即功能基因组时代已经来临,相应的对生物信息学的要求也发生了新的变化,要求研究者理解生物内在的规律性。清华大学生物信息学研究所所长李衍达先生的在全国首届生物信息学大会上作了“以信息系统的观点了解基因组”的报告中,强调应重视生物内部信息系统分析。 李衍达院士在报告中概括的指出现在的研究方向应有一小段或单个蛋白独特的生物化学功能研究转向生物过程研究,从单因素影响研究转向多因素影响的研究,从个别实验结果的分析转向生物内部活动规律的理解,从单个生物分子研究转向多个生物分子作用的研究,最终理解生物内部的规律。应将信息与信息结构为内涵对基因组序列作
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全国首届生物信息学大会在京隆重召开
新生命网站消息:2001年4月11日上午,首届中国生物信息学大会在军事医学科学院隆重召开。本次大会由国家人类基因组研究北方中心、南方中心、华大基因研究中心、军事医学科学院与北京市科委、北京生物工程学会生物信息学专业委员会、北京生物技术和新医药产业促进中心等单位共同主办,第一次大规模汇集和展示我国在生命科学的重要领域——生物信息学方面的最新进展。中国科技部生物工程开发中心、国家自然基金委、北京市科委的有关领导出席了会议,来自全国各地及海外的著名专家、学者共300多人齐聚京城,参加此次见证我国生物信息学发展历程的盛会。 众所周知,人类基因组图谱的完成,只是人类基因组计划的第一步。从基因组序列
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中医药治疗红斑狼疮获新进展
央视国际网络消息:中医药治疗红斑狼疮又获新进展。北京崇文区东华医院老中医曲治国提出致病机理新说,并据此研制成纯中药制品狼癜散,临床治疗逾千例效果显著,先后荣获世界传统医药大会金像奖和首届世界华人医药大会华佗杯一等奖。 红斑狼疮是严重危胁人类健康的顽症之一,我国现每年新增患者约60万,占世界新增患者总数的1/7。目前国内外尚无疗效确切的治疗药物,大部分临床采用皮质激素、免疫抑制剂等作临时控制,结果很多患者不是死于本病而是死于药物副作用。 担任中国中医研究院药物开发中心研究员、哈尔滨东方红斑狼疮中医研究所所长的曲治国出身中医世家,在长期医疗实践中形成了对
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前列腺癌疫苗研究有所进展
星光医药网消息:在研究前列腺癌疫苗的过程中,加利福尼亚的科学家确定了一种能发展为疫苗的遗传目标。他们在周二召开的试验生物学2001年会议上公布了他们的发现。加利福尼亚大学的James Allison博士和Marcella Fasso博士确定并克隆一个编码前列腺癌细胞关键表面蛋白的基因。这些表面蛋白能作为抗原,引发免疫响应。 在路透社的采访中,Allison说完成小鼠发现后,他的研究小组利用了遗传数据库,计划在人类前列腺癌中发现相似的分子。他说:“我们找到了它,称之为前列腺癌特殊T细胞刺激子(SPAS-1)。Allison说,下一步就是利用人类前列腺癌抗原产生相应的
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内蒙古科学家合成新型抗艾滋病毒化合物
北京青年报消息:内蒙古大学高分子科学研究所所长博日吉汗·格日勒图教授以蒙药多糖等做基本原料,成功合成了3种低毒高抗艾滋病毒活性的新型多糖药用化合物。 据博日吉汗·格日勒图教授介绍,这3种新的药用化合物转性蒙药多糖、转性氨基多糖和抗艾滋双效缓释剂,均以从内蒙古传统草药中提取的多糖化合物为主要原料。目前,这3种化合物刚刚完成体外试验,何时进入临床尚需时日。 格日勒图教授告诉记者,在国际抗艾滋病研究领域极具权威性的日本国鹿儿岛大学微生物学和免疫学系已经对这3种化合物的13个样品和4个标准药物,在相同条件下,通过体外实验(细胞或血液实验)进行了抗艾滋
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Progenics公司新药在小鼠试验中成功抑制HIV
生物通编译:路透社纽约消息——Progenics制药公司(Progenics Pharmaceuticals Inc.)周一宣布其实验性药物PRO 140将接受了移植的人免疫细胞,然后感染导致艾滋病的HIV的小鼠体内HIV水平降低到不能检测到的水平。纽约的这家公司的Tarrytown股票昨天下午在这一消息公布后,在那斯达克股票市场上从$1.99上涨了17.3%达到$13.49。该公司的这种药物是一种设计来阻止HIV与感染部位的一个关键蛋白质CCR5发生联系的单克隆抗体。CCR5是人体免疫系统细胞的一个胞外成分。Progenics公司说HIV与感染部位或受体相互作用是其潜入人体免疫细胞并寄生在其
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研究证明大豆能预防阿尔兹海默氏症
新华社4月5日 洛杉矶消息,人们都知道多吃大豆可以预防心脏病和骨质疏松症,美国的一项最新研究表明,多吃大豆还可以预防老年人患阿尔兹海默氏症。美国阿拉巴马大学研究人员日前表示,他们在三年的动物实验中发现,大豆中含有的植物雌激素可以减少脑部可导致阿尔兹海默氏症的蛋白质变异。研究人员将45只成年母猴的卵巢切除,然后将它们分成三组,一组喂食含有植物雌激素的大豆,一组喂食不含植物雌激素的大豆,另一组喂食即不含植物雌激素也不含雌激素补充剂的大豆。研究人员对这些猴子的脑部组织进行检查,结果发现第一组猴子脑部蛋白质变异的情况最少,另外两组情况则大致相似。研究人员称,多吃大豆对于已过更年期的妇女尤其重要,而对于
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实验性艾滋疫苗露出希望
【生物通编译】路透社 华盛顿消息:Merck & Co. 公司的科学家们本周一宣布,他们以引起普通感冒的病毒为基础构建的一个实验性艾滋病疫苗尽管不能防止感染,但可以阻断实验猴子的病情发展进入严重阶段。默克研究实验室的疫苗研究者负责人,John Shiver说,这一发现带来了将来在HIV感染者中使用人类艾滋疫苗遏制疾病的发展的可能性。Shiver在采访中说:“考虑到艾滋病是一种多么危险的流行病,以及它给人类带来的威胁,如果我们的疫苗可以控制感染但是不能预防感染,那么在开发出更好的疫苗之前,这样的疫苗也是有价值的工具。”他还说他不能排除在这次实验中使用的模型之后出现的某个疫苗可以防止最初感染的可能
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病毒学家们不再认为异种移植危险
【生物通编译】最初提出感染异种移植的猪器官的内源反转录病毒的危险的病毒学家宣称,这种危险实际上并不存在。伦敦国家医学研究所,病毒基因组学研究组的负责人Johnathan Stoye肯定异种移植具有巨大的前途。“我认为PERV(猪内源反转录病毒)的危险基本上不存在。其它病毒带来的危险可能大一些,但是我不知道。”他现在担心的是英国在这个领域的发展受到公众误解和游说议员的动物权利主义者的牵制。Stoye昨天在于爱丁堡的Heriot-Watt大学召开的综合微生物学协会年会上说:“供移植的器官相当短缺……在英国缺少数千个,欧洲数万,美国数十万。”他说,这种短缺是如此令人绝望,因此动物器官已经进入了许多人