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Nature子刊：一种新颖的高灵敏表观基因组技术
关于疾病，以及我们的身体对疾病的反应方式，至今我们仍然知之甚少，部分原因在于人类基因组是一个完整的DNA组装体，我们每个人都有独一无二的序列。弗吉尼亚理工大学的一个研究小组近期研发了一种新的表观基因组技术，可以帮助我们了解人体如何对抗疾病。这一研究成果公布在Nature Protocols杂志上。从左到右，Bohan Zhu 和Yuan-Pang Hsieh、Chang Lu弗吉尼亚理工大学化学工程学教授Chang Lu和他的两个博士生：Bohan Zhu和Yuan-Pang Hsieh，研发了一种介绍了微流体新技术，可以研究从乳腺癌、脑癌到精神分裂症和药物成瘾等多种疾病。Chang Lu表示
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怀孕期间的烹饪方法可能会引发儿童的多动症
怀孕的妇女暴露于烹饪产生的油烟与其孩子在3岁时面临更高的多动行为风险相关。这些发现来自于一项发表于国际期刊Indoor Air的研究，该研究在2015年至2017年间在中国深圳新入学的儿童中展开，并对45,518对母子进行了调查。该研究在6,053名儿童中发现了多动行为。与使用电力烹饪的母亲相比，在怀孕期间使用煤或天然气等烹饪燃料的母亲，其幼儿出现多动行为的风险更高。此外，母亲怀孕期间做饭的频率越高，儿童出现多动行为的风险就越大。烹饪过程中通风不良也会带来更高的风险。在根据社会阶层、教育程度和其他因素划分的各亚群之间，研究结果是相对一致的。作者写道：“如果将来在纵向干预性研究中得出同样的结果，
来源：EurekAlert中文
时间：2019-12-05
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控制微生物代谢生产的新方法
微生物经过基因工程改造后可用于生产各种有用的化合物，包括塑料，生物燃料和药品。但是，在许多情况下，这些产品的合成需要与维持微生物生长的代谢途径竞争。为了优化微生物生产所需化合物的能力、同时维持其自身生长，麻省理工学院的科学家设计了一种方法，可以诱导细菌在不同时间在不同的代谢途径之间进行切换。这种转换开关被插入到细胞基因组中，由微生物种群密度的变化触发，无需人工干预。利用这种转换，研究人员可以将两种不同的微生物产物的产量提高十倍。文章发表在PNAS上。麻省理工学院的研究生Christina Dinh是该论文的主要作者。Kristala Prather教授是通讯作者。双重开关为了使微生物能合成生产
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在癌症发生前就扼杀它们，一种新技术可以直观描述癌细胞发生
杜克大学癌症研究所的研究人员发现了干细胞突变如何悄然出现，并扩散到整个结肠区域，直到最终占主导地位并成为恶性肿瘤的过程。他们通过在小鼠中使用创新性的建模系统，使干细胞发光，标记结肠癌的突变。然后在动物体内观察到在结肠癌中发现的突变，阐明了一种正在进行的“死亡竞赛”，其中一种或另一种突变优于其他突变，成为恶性肿瘤的驱动力。这一发现公布在12月2日的Nature Communications杂志上。杜克大学外科和细胞生物学系的助理教授Joshua Snyder博士说：“这项研究为突变前癌干细胞在整个结肠癌和种子癌中扩散的无形过程，提供了新的见解。”“我们的技术为测试可中断这种早期恶性过程的新疗法奠
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BioTechniques：一种方便的前列腺癌检测方法
英国东英吉利大学等机构的研究人员近日开发出一种简便的前列腺癌检测方法，可以利用自行收集的尿液样本开展。这种方法发表在《BioTechniques》上，可诊断侵袭性前列腺癌，并更早预测患者是否需要治疗。这种检测可在自行收集的尿液样本上开展，这意味着男性无需跑去医院提供尿液样本，也不必接受不舒服的直肠检查。研究人员认为，前列腺癌的诊断又向前迈进了一大步，因为清晨的第一次尿液可提供一致性更好的生物标志物水平。这种“在家收集试剂盒”的引入将彻底改变疾病的诊断方法。东英吉利大学诺维奇医学院的首席研究员Jeremy Clark博士表示：“前列腺癌是英国男性中最常见的癌症。它通常进展缓慢，而且大多数人不需要
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突破性进展！Hi-C建库突破1千个细胞水平！
降低建库起始量一直都是安诺Hi-C产品的研发重点之一，2019年以来，安诺三维基因组学研发团队披荆斩棘、坚持不懈，用半年的时间攻克了千个细胞Hi-C建库大关，实现了降低Hi-C建库起始量的三次飞跃，成功将Hi-C建库起始量由500万个细胞逐渐降低至1千个细胞，率先实现了微量细胞样本Hi-C建库的产业化服务。样本要求样本类型：细胞（人、鼠或其他物种）建库起始量：1千个交联细胞样本/文库测序平台：Illumina HiSeq X Ten，PE150文库质控对10多例人和小鼠的细胞样本进行了稳定性测试，评估结果显示，人细胞样本的文库Interaction Rate均在85%以上，小鼠细胞样本的文库I
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肝功能研究获突破 人体69基因与肝功能失调有关
在一项新的全基因组相关性研究中，一个国际科研团队对6.1万人的基因组进行了比较，在其遗传代码中找到了42个与肝功能有关的区域，其中32个区域是首次得到确认。研究人员同时在这些区域“揪出”了69个与肝功能有关的基因，有望为肝病患者找到新疗法。研究发表在《自然·遗传学》杂志上。最新研究由英国帝国理工学院科学家领导的一个国际科研团队进行。这项工作能让科学家们更好、更精确地获悉导致肝脏不再正常运转的原因并以此研发出新疗法，改进肝病患者的肝脏功能并帮助预防肝损伤。肝脏是身体内以代谢功能为主的器官，是身体内最大的器官。肝脏可以处理数百个不同的任务，包括制造蛋白质和凝血因子；帮助消化、释放能量、去氧化、储存
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Nature Methods：科学家第一次研发出植入式核磁共振检测技术
来自德国和瑞士的神经科学家、电气工程师组成的一个团队开发了一种高度灵敏的植入检测仪，能以无与伦比的时空分辨率探测大脑生理机制。这种检测仪带有集成芯片的超细针，该芯片能够检测和传输纳升级的大脑氧代谢核磁共振（NMR）数据。这一突破性的设计公布在11月25日Nature Methods杂志上，科学家们指出，这种重要的技术将会给生命科学研究，尤其是神经科学研究带来全新的应用。马普生物控制论研究所Klaus Scheffle，以及德国斯图加特大学的Jens Anders领导了这项研究，他们找到了一种技术“桥梁”，能突破当代脑部扫描方法的电物理极限。他们开发的毛细管整体式核磁共振针（capil
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专访赛业生物董事长：以技术创新破局，引领行业发展
Q：赛业生物十几年来一步步发展成为国际知名的模式动物基因改造公司，这期间，公司走过了一段怎样的发展历程？A：大家都知道我们是做基因工程老鼠的，过去十年我们埋头给生命科学和生物医药圈里的研究人员定制各种基因改造的老鼠，我们一般不知道也不关心他们为什么要做这些基因改造。他们把成果拿走之后我们也基本不了解他们后续的研究，直到有一天他们中的一些人发表文章引用了我们公司的名字。在初创阶段，我们把发展重点放在了扩大业务、提高效率、降低成本上，我们第一次运用工程化的方法论和信息化的管理把千变万化的个性化服务搬上了标准的流水线，我们也通过生物信息学和智能化把从方案设计到生产管理到项目结题的全过程基
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美国麻省总医院新技术或可帮助判断毛囊健康状况
人们常把脱发与现代人常见的工作压力大和长期熬夜等现象联系在一起，社交媒体上脱发的话题热度也一直不减。事实证明，确实有多种因素可能会阻碍头发正常生长，导致毛发疾病和脱发，但如何治疗脱发以及不同疗法的效果该如何衡量仍然悬而未决。 近期，美国麻省总医院的研究人员开发出一种新方法来检测毛囊活性，并可用于测试不同疗法对头发生长的影响。该研究的相关结果已发表在英国《科学报告》杂志上。研究人员发现，当毛囊健康的头皮区域受到轻微按压时，该区域就会产生稳定的磁场。该磁场可通过脑磁图描记术（MEG）进行测量。基于以上发现，研究人员通过头盔状的脑磁图测量了每个参与者头皮多个位置毛囊的活动情况，并绘制了相应
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无细胞糖基化系统 新方法可加速蛋白质药物开发
蛋白质的糖基化——糖与蛋白质的结合——在细胞功能和蛋白质药物的开发中都起着至关重要的作用。糖结构可使这些蛋白质保持稳定，同时使蛋白质能够执行其功能。一直以来，研究人员不得不利用哺乳动物细胞的生物合成途径来构建和研究这些糖结构。而相对简单得多的原核表达系统和无细胞表达系统，则因为无法有效进行糖基化等真核蛋白质特有的翻译后加工而受限，难以用于多数蛋白质药物生产。现在，美国西北大学工程研究人员开发出一种快速，无细胞的GlycoPRIME系统来构建和研究这些糖基化途径，有望加快蛋白质药物的开发速度，并提供一种新的、可在资源有限的情况下按需生产药物的模块化方法。“这是一种令人兴奋的新方法，它可以通过糖基
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中国的小学、学生父母及其祖父母/外祖父母是儿童肥胖预防的有效突破口
据一项历时10年的干预研究显示，向中国城市小学儿童的父母和祖父母/外祖父母普及相关知识和育儿技巧，于此同时提高儿童校内和校外的身体运动量并改善学校的午餐营养质量可经济高效地预防中国城市儿童肥胖。该研究是全球规模最大，最为严谨的儿童肥胖预防干预研究之一。在中国7至18岁的儿童中，超过3,000万人有超重或肥胖的问题，这让他们更有可能面临早逝的风险。若不采取有效的干预措施，预计到2030年，这一数字将上升到5,000万，而祖父母/外祖父母不适当的喂养观念和行为是这一问题日趋严重的因素之一。英国伯明翰大学和布里斯托大学的研究人员与广州市疾病预防控制中心合作，从广州40所小学招募了1,641名六岁的儿
来源：EurekAlert中文
时间：2019-11-28
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重磅| 可提高肿瘤cfDNA20倍捕获量，肿瘤早期诊断取得重大突破！
早诊早治，提高生存率对抗癌治疗至关重要，近年来，分子诊断技术已逐渐被应用于肿瘤的早期筛查、快速诊断的研究中。国内癌症早期诊断市场规模预计已达万亿级别，癌症早诊领域正逐步实现产业化，却依然非常缺乏先进有效的自主核心技术。但在近日刚刚完成的重庆市2019年度渝商评选中，一家企业因其自主创新研发的肿瘤早诊快诊技术取得的卓越成绩而入围“2019年度新锐渝商”，引起了众多关注。近日，我们有幸访问到刚刚荣获2019年度十大新锐渝商的重庆威斯腾生物有限责任公司的周勇董事长，了解其团队将分子诊断技术应用于肿瘤早诊快诊方面的进展与突破。国内癌症早期诊断市场规模达万亿级今年1月，有关部门发布的最新一期全国癌症统计
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Oxford Nanopore开发染色质构象捕获新技术
上周，威尔•康奈尔医学院和Oxford Nanopore Technologies公司在预印本网站bioRxiv上发表了一种新颖的纳米孔测序技术。这种名为Pore-C的技术将染色质构象捕获与ONT长片段相结合，能够对多向染色质接触进行直接测序，而无需扩增。众所周知，3D基因组会影响基因调控。目前，人们已采用染色质构象捕获（3C）分析来绘制细胞核中发生空间相互作用的各对位点。不过，成对的相互作用显然还不够。随着基因组的折叠，许多DNA位点可能都参与了基因表达。染色质构象捕获与纳米孔长片段的结合，意味着单个片段可以跨越多个接触点，从而获取更高阶的多向信息。作者表示，Pore-C是一种简
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Nature新技术：单分子水平分析转运蛋白
就像小船可以搭乘乘客穿越河流一样，转运蛋白可以在细胞膜上移动物质。这个过程对于从细菌到人类的生命形式细胞的健康运作至关重要。这些转运蛋白的功能之前是从成百上千个协同工作的行为中推断出来的，而最新发表在Nature杂志上的一项新研究利用一种技术可以一次完成一种转运蛋白的解构。文章作者Scott Blanchard说：“通过观察单个分子的活性，我们已经发现了转运蛋白活性潜在机制的一部分，这对该家族中许多临床相关蛋白的未来研究至关重要。” 新技术开辟了新的可能性这项研究采用了一种称为单分子荧光共振能量转移（smFRET）的技术。这一方法EBF研究人员能够收集各个转运蛋白活动的精确测量值。这种前沿技术
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绘制NLR组，多种测序技术解析植物的免疫力
一直以来，育种人员都希望揭开植物免疫的秘密，而他们的兴趣主要集中在那些可以激活免疫信号的受体上，包括识别微生物相关分子模式（MAMP）细胞表面蛋白，以及感知病原体效应蛋白的细胞内蛋白，如含有核苷酸结合结构域和富含亮氨酸重复序列的受体（NLR）。在开花植物的基因组中可找到数百个NLR基因。人们认为，它们会形成类似炎症小体（inflammasome）的结构，在识别病原体后控制细胞的死亡。同时，它们也成为改造病原体抗性的候选对象。基于这些原因，研究人员希望在不同分类水平建立NLR基因目录。不过，此基因家族的多态性特别高，等位基因和结构变异模式复杂，并且成簇存在，这些因素都阻碍了人们的研究工作。近日，
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中外学者Cell Stem Cell突破山中伸弥iPSCs配方，原来OCT4并不需要
胚胎干细胞（ESCs）分离于胚胎的内细胞团，具有发育成为个体所有细胞的潜能，被广泛应用于生物学研究的各个领域，是干细胞与再生医学研究的焦点；而诱导性多能干细胞（iPSCs）是通过转录因子或者小分子化合物逆转终末分化的体细胞，使其重编程而得到类似于ESCs的发育和分化潜能。日本科学家山中伸弥（Shinya Yamanaka）于2006发现通过表达四个转录因子 – Oct4，Sox2，Klf4和cMyc（OSKM）可将小鼠成年体细胞（如皮肤成纤维细胞）重新编程为iPSCs，并在2007年发现OSKM可以应用到人iPSCs的诱导，开辟了体细胞重编程的新领域，并于2012年获得诺贝尔生理与医学奖。iP
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Cancer Cell突破性成果：重新审视癌症转录因子，实现肿瘤持久消退
几十年来，一种称为STAT3的转录因子一直是癌症治疗中的主要治疗靶标。但是由于难以开发出有效抑制其活性的化合物，因此STAT3在很大程度上被认为是“不可治疗的”。但是近期，来自密歇根大学的研究人员已经开发出了一种有潜力的新方法来靶向STAT3，他们研制了一种小分子化合物，可以利用自然细胞“清除”系统的力量来完全消除它，而不是传统的抑制其活性的方法。这一研究成果公布在Cancer Cell杂志上，作者表示，在白血病和淋巴瘤的小鼠模型中，这种U-M化合物能够实现持久且几乎完全消除肿瘤。实验证明，在白血病的小鼠模型中，这种复合物消除了所有肿瘤，小鼠保持无肿瘤状态60天。在实验结束时，在两种小鼠淋巴瘤
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SfN年会聚焦转录组学技术在神经科学中的应用
2019年美国神经科学学会年会（Neuroscience 2019）于早些时候在美国芝加哥举行。全世界的神经科学家汇聚一堂，向专家学习，与同行合作，探索新工具和技术，共同推动神经科学的发展。近年来，转录组学技术在飞速发展，这使得研究人员有机会在单细胞水平上研究脑部疾病和发育。Neuroscience 2019上发表的一系列摘要也强调了这一点。研究人员利用转录组学来研究与成瘾、退化和正常发育相关的细胞过程。宾夕法尼亚大学的Philipp Mews首先介绍了如何在可卡因成瘾的小鼠模型上使用转录组学方法。他的团队证明了反复接触毒品会引起表观遗传学改变，这些改变也造成了与成瘾相关的不良行为，如渴求和复
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2019年全球市值最高的25家生物技术公司
上个月，Biogen发布了一条重磅消息。它计划向美国FDA提交与日本Eisai共同开发的阿尔茨海默病治疗药物aducanumab的上市许可申请。消息一公布，投资者便蜂拥购买Biogen的股票，使得该公司的股票价格在当天开始交易前就飙升了40%。当天Biogen股价上涨26%，以281.87美元收盘。阿尔茨海默病治疗药物aducanumab的消息不仅带动了Biogen的股价，也促使大多数生物技术公司的股价在接下来的几天内上涨。GEN网站按照惯例在10月30日对全球生物技术公司的市值进行排名，评出全球25大生物技术公司（Top 25 Biotech Companies of 2019）。2019年
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