• 解谜隐藏基因组的新技术:未知的DNA序列可能对人类健康至关重要

  大量的短核糖核酸编码微蛋白和多肽的序列已经被确定，为疾病研究和药物开发提供了新的机会。杜克大学-新加坡国立大学医学院的研究人员和他们的合作者在人类基因组中发现了数千个以前未知的DNA序列，这些序列编码对人类健康和疾病至关重要的微蛋白和多肽。计算生物学家Sonia Chothani博士解释说:“我们对已知的2%编码蛋白质的基因组的大部分理解来自于寻找蛋白质编码核苷酸序列的长链，或长开放阅读框。”Sonia Chothani博士是杜克-新加坡国立大学心血管和代谢疾病(CVMD)项目的研究员，也是该研究的第一作者。“然而，最近科学家们发现了小型开放阅读框(smORFs)，它也可以从RNA翻译成小肽，

  来源：Molecular Cell

  时间：2022-09-14

• 目前的疫苗方法不足以根除麻疹

  这篇论文今天发表在《柳叶刀全球卫生》杂志上，探讨了在93个疾病负担最重的国家使用主要疫苗接种策略消除麻疹和风疹的可行性。尽管全世界麻疹和风疹新病例数量显著减少，但在目前的传播水平和消除疾病水平之间仍然存在差距。佐治亚大学公共卫生学院流行病学和生物统计学助理教授、主要作者艾米·温特说:“麻疹是最具传染性的呼吸道感染之一，它传播很快，所以很难控制。”麻疹的基本繁殖数(R0)约为18，它表示一个感染者可能在完全易感人群中传播该疾病的人数。相比之下，原始SARS-CoV-2病毒的R0估计在3左右。2017年，世界卫生组织总干事要求提交一份关于根除麻疹和风疹可行性的报告。该报告的一个组成部分是使用传播模

  来源：University of Georgia

  时间：2022-09-14

• 比较神经网络的新方法揭示了人工智能是如何工作的

          图:洛斯阿拉莫斯大学的研究人员正在寻找比较神经网络的新方法。这张图片是由一款名为“稳定扩散”的人工智能软件制作的，使用的提示是“窥探神经网络的黑盒子”。    图片来源:洛斯阿拉莫斯国家实验室洛斯阿拉莫斯国家实验室的一个团队开发了一种新的方法来比较神经网络，这种方法可以在人工智能的“黑匣子”中查看，以帮助研究人员理解神经网络行为。神经网络识别数据集中的模式;虚拟助手、面部识别系统和自动驾驶汽车等应用程序在社会中无处不在。“人工智能研究团体并不一定完全理解神经网络在做什么;它们给了我们很好的结果，但我们不知道是如

  来源：

  时间：2022-09-14

• 新的成像方法揭示了罕见眼病脉络膜血症的重要细节

          图像:脉络膜血症男性参与者的RPE细胞(见圈出的例子)，显示使用Tam的多模态成像方法可以检测到增大的RPE细胞。    图片来源:Johnny Tam/美国国家眼科研究所通过将传统的眼睛成像技术与自适应光学技术(一种提高成像分辨率的技术)相结合，美国国家眼科研究所(NEI)的研究人员首次展示了脉络膜血症患者眼睛不同组织层的细胞是如何受到影响的，脉络膜血症是一种罕见的导致失明的遗传疾病。他们的研究是由NEI校内研究项目资助的。NEI临床和转化成像单元的负责人Johnny Tam博士将自适应光学与吲哚菁绿染料结合

  来源：Communications Biology

  时间：2022-09-14

• 一种新的数据分析方法确定与疾病相关的剪接变异

          图:受克罗恩病风险变异体(sQTL变异体)调控的CARD9选择性剪接改变了蛋白质结构。    资料来源:TMDU基因组功能与多样性部来自东京医科和牙科大学(TMDU)的研究人员发现，整合和选择性分析拼接变异数据可以帮助识别与复杂人类疾病相关的遗传变异  在大数据时代，获取大量信息是最容易的部分;而知道如何利用它则完全是另一回事。但现在，来自日本的研究人员报告说，一种分析全基因组关联研究数据的新方法可能有助于揭示许多疾病的遗传基础。发表在八月的一项研究中自然通讯来自东京医科和牙科大学(TMDU)的研究人

  来源：Nature Communications

  时间：2022-09-13

• 国家重点研发计划项目“猪禽动态营养需求与营养精准供给技术研究”召开项目启动会暨执行与管理方案论证会

  　　9月6日，中国科学院亚热带农业生态研究所组织召开国家重点研发计划项目“猪禽动态营养需求与营养精准供给技术研究”启动会暨执行与管理方案论证会，会议采用线上线下结合的方式召开。 　　中国农村技术开发中心农业科技处王文月副研究员和综合监督处何晓燕副研究员，项目推荐单位中国科学院科技促进发展局曾艳研究员，项目牵头单位中国科学院亚热带农业生态研究所党委副书记文再坤、科技管理与规划处处长刘守龙、财务资产处处长童自然，专项咨询专家华南农业大学吴珍芳教授、中国农业科学院北京畜牧兽医研究所熊本海研究员，项目咨询专家中国科学院亚热带农业生态研究所印遇龙院士、河南科技大学王占斌教授、湖南农业大学贺喜教授等出席会

  来源：中国科学院亚热带农业生态研究所

  时间：2022-09-13

• 广西重点研发计划项目“大石山区经果林坡地多界面径流集蓄与智能灌溉技术研究与示范”召开项目启动暨实施方案论证会

  　　9月9日，中国科学院亚热带农业生态研究所组织召开了广西重点研发计划项目“大石山区经果林坡地多界面径流集蓄与智能灌溉技术研究与示范”的项目启动会暨实施方案论证会，会议采用线上线下结合的方式召开。 　　项目咨询专家华中农业大学蔡崇法教授和史志华教授、中科院水土保持研究所赵西宁研究员、中科院南京地理与湖泊研究所朱青研究员、广西农业科学院刘永贤研究员、河池学院覃国乐教授，项目牵头单位亚热带生态所党委书记王克林、副所长陈洪松以及李德军、张伟、赵杰等科研骨干出席会议。项目负责人付智勇、项目骨干和项目参与人员等30余人参与会议。项目启动会由亚热带生态所科技管理与规划处副处长何寻阳主持。 　　会上，付智勇

  来源：中国科学院亚热带农业生态研究所

  时间：2022-09-13

• 周源课题组建立基于图表示深度学习的单细胞转录组数据填补方法GE-Impute

  单细胞转录组测序（scRNA-seq）能够从单个细胞水平对转录组进行研究，可以最大程度反映细胞间的异质性，并为鉴定新的细胞亚群和阐明细胞状态转换的调控机制提供技术支持。近年来，10X Genomics、Smart-seq2、Fluidigm C1等技术平台的出现，极大地推动了单细胞测序的发展，使其广泛地应用于基础科研与临床研究中。然而，由于单个细胞的mRNA表达量较低以及测序技术的噪声原因，使得单细胞测序数据中存在较多的drop-out现象，即很多mRNA未被捕捉到导致检测出来基因表达值为零，而这些噪声数据会影响单细胞数据下游分析的准确性

  来源：北京大学基础医学院

  时间：2022-09-13

• 我院市川宗严研发一种体外人工微管组装技术新方法

    

  来源：复旦大学生命科学学院

  时间：2022-09-13

• Cell子刊突破性发现：一种以前所未有的方式杀死细菌的毒素

          Nathan Bullen（左）和John Whitney检查纯化毒素的晶体，他们用x射线晶体学来解决其三维结构。    麦克马斯特大学的研究人员发现了一种以前未知的杀菌毒素，这可能为新一代抗生素的研制铺平道路。这项研究表明，细菌病原体铜绿假单胞菌会分泌一种毒素，这种毒素已经进化到可以杀死其他种类的细菌。对Whitney来说，他的发现的关键不仅仅是这个 这种毒素能杀死细菌，但如何杀死细菌呢 它确实如此。生物化学和生物医学科学系副教授Whitney说:“这项研究意义重大，因为它表明，这种毒素以其他细菌的基本RNA

  来源：Molecular Cell

  时间：2022-09-08

• 新技术有助于发现引起脑膜炎的细菌是否对抗生素有耐药性

          图:在没有分离菌株的情况下，也可以用来研究肺炎球菌的耐药谱(显微镜下观察的肺炎球菌)    发表在《PLOS ONE》杂志上的一项研究有朝一日可以帮助卫生工作者确定肺炎链球菌这一类型的细菌是否对抗生素有抵抗力，肺炎链球菌是导致脑膜炎--包裹大脑和脊髓的膜的炎症。当使用传统方法时，这种类型的分析不是一件容易的工作。细菌必须从病人的样本中分离出来并在活着的时候进行分析，这是很困难的，因为微生物很敏感，通常无法在到达实验室的过程中存活下来。巴西Adolfo Lutz研究所(IAL)的Santo André分支机构的研

  来源：PLoS ONE

  时间：2022-09-08

• 新的研究表明氯胺酮可能是治疗儿童ADNP综合征的有效方法

          图片:西奈山西维尔自闭症研究和治疗中心临床主任Alexander Kolevzon博士和试验参与者。    图片来源:西奈山卫生系统这是一项小型但独特的研究，由西奈山西维尔自闭症研究和治疗中心的研究人员领导，提示低剂量氯胺酮一般是安全的，耐受性良好，有效地治疗被诊断为ADNP综合征(也被称为Helsmoortel-VanDerAa综合征)儿童的临床症状。，一种罕见的神经发育障碍，由活性依赖的神经保护蛋白(ADNP)基因。的ADNP基因影响大脑的形成、发育和功能，其产生的蛋白质有助于控制其他基因的表达。ADNP突

  来源：Human Genetics and Genomics Advances

  时间：2022-09-08

• 模拟复杂分子相互作用的技术有助于研发癌症和COVID-19等疾病的新治疗方法

  明尼苏达大学双子城分校生物医学工程师领导的一个团队开发了一种普遍可访问的应用程序，可以模拟复杂的分子相互作用，这将使研究人员能够设计出更好的治疗癌症和COVID-19等疾病的方法。该论文基于研究人员在2019年发表的一项研究。现在，他们扩展了这项技术，以模拟更复杂的分子相互作用，让非专家更容易使用该应用，并将他们的发现用于阐明SARS-CoV-2病毒是如何感染人体的。这项研究发表在自然通讯，一份同行评议的开放获取的科学期刊。这款名为MVsim的应用程序可供其他研究人员免费使用GitHub．该模拟器预测多价相互作用的强度、速度和选择性，其中涉及具有多个结合位点的分子，可用于开发治疗疾病的药物，特

  来源：Nature Communications

  时间：2022-09-08

• 新的成像技术提高了大多数常见皮肤癌的诊断准确性

  根据在第31届欧洲皮肤与性病学会(EADV)大会上提交的一项新研究，与单纯的临床和皮肤镜检查相比，一种新的成像技术显著提高了基底细胞癌(BCC)诊断的准确性，基底细胞癌是最常见的皮肤癌。1研究发现，使用一种新的非侵入性皮肤成像技术，称为线场共聚焦光学相干断层扫描(LC-OCT)，它能在细胞水平上提供详细的3D图像，显著提高了诊断的准确性。在鉴别基底细胞癌和基底细胞模子癌(如鳞状细胞癌、光化性和脂溢性角化病、真皮痣和炎症性条件)方面，与最常用的皮肤癌诊断技术单纯皮肤镜检查相比，LC-OCT显著提高了12%的诊断准确性(从85%提高到97%)。重要的是，在区分浅表基底细胞癌(一种可以非手术治疗的亚

  来源：

  时间：2022-09-08

• Nature子刊：癌症免疫治疗新突破，斯坦福大学寻找触发特定免疫细胞的抗原的新方法

  科学家们开发了新的方法来更快、更准确地找到触发特定免疫细胞的抗原细胞的秘密可以从它的表面揭示出来。它装饰着数万到数十万个分子，帮助免疫细胞区分敌友。其中一些突出的分子是抗原，触发免疫系统攻击。然而，科学家们很难在分子森林中识别出这些抗原，这些抗原通常在个体之间存在差异。斯坦福大学的一组科学家开发了一种新的方法，可以更快更准确地预测哪种抗原会引发强烈的免疫反应。他们的方法可以帮助研究人员开发出更有效的癌症免疫疗法。这项研究由Sarafan ChEM-H研究所的学者Polly Fordyce领导，今天(2022年9月5日)在《Nature Methods》杂志上发表。T细胞是一类免疫细胞，当它们在

  来源：Nature Methods

  时间：2022-09-06

• 斯坦福大学开发培育黑猩猩干细胞的新技术

  <img src="https://med.stanford.edu/news/all-news/2022/08/stanford-medicine-researchers-take-early--critical-step-toward-g/_jcr_content/main/image.img.620.high.jpg/shutterstock_1596373153.jpg" alt="kidneys" _src="https://med.stanford.edu/news/all-news/2022/08/stanford-medi

  来源：med.stanford

  时间：2022-09-06

• 新方法通过“饥饿”脑肿瘤来根除致命的脑肿瘤

  该研究由博士生Rita Perelroizen领导，在Shmunis生物医学和癌症研究学院和Sagol神经科学学院的Lior Mayo博士的监督下，与美国国立卫生研究院(NIH)的Eytan Ruppin教授合作。这篇论文发表在科学杂志《Brain 》上，并附有特别评论。研究人员解释说:“胶质母细胞瘤是一种极具侵略性和侵袭性的脑癌，目前还没有已知的有效治疗方法。肿瘤细胞对所有已知的治疗方法都具有高度的耐药性，不幸的是，在过去的50年里，患者的预期寿命并没有显著增加。我们的发现为开发治疗胶质母细胞瘤和其他类型脑肿瘤的有效药物提供了一个有希望的基础。”Mayo博士:“在这里，我们从一个新的角度应对

  来源：Brain

  时间：2022-09-06

• 基于大型队列和单细胞RNA测序技术开展狼疮免疫调节研究

  为了配合狼疮宣传，我们在此分享两项创新研究，这两项研究带来了有关系统性红斑狼疮（SLE）的新见解，有助于了解循环免疫细胞的基因组差异与细胞类型特异性的基因表达特征之间的关系。这些结果有助于确定狼疮的遗传基础，并表征下游驱动自身免疫性疾病的细胞和分子机制。对于一种每位患者的表现都不同的疾病，该如何诊断和治疗？系统性红斑狼疮（SLE）就是这样一种高度异质性的自身免疫性疾病，导致受影响的器官（包括关节、皮肤、脑、肺、肾和血管）出现广泛的炎症和组织损伤(1)。出于这个原因，医生和科学家仍然很难确定病因，需要以更大规模对狼疮的免疫图谱进行更深入的分子表征。尽管狼疮的临床表现多种多样，但Perez等人和Y

  来源：10x Genomics

  时间：2022-09-06

• 脑成像的新方法使小鼠的头骨完好无损

          a1大视野双通道双光子显微图像，双半球皮层血管(红色，德州红)和神经元(绿色，EGFP)建立TIS窗口后。(a1)缝线附近相应色框的高倍放大图像(用20×物镜观察)。a5-a10 (a2)-(a4)中白色边框(白色箭头指示)的高倍放大(放大)图像。b TIS窗建立前后及颅骨取出后不同深度神经元的典型双光子显微镜图像。c不同条件下不同成像深度图像的sbr。d TIS窗与开颅玻璃窗对树突状脊柱成像的比较。激发波长为920 nm (80 MHz, 140 fs)。    对于研究各种脑部疾病的人来说，在不造成任何损伤

  来源：eLight

  时间：2022-09-06

• Sci Rep：直接测量骨骼肌肌管强度的方法

          图:当对硅胶基材施加力时，表面会出现皱纹。这同样适用于肌管表面受到电信号刺激的情况。皱纹的长度可以用来描述肌管收缩的力量。    图片来源:东京都大学东京都市大学的研究人员已经开发出一种方法来表征收缩肌管(骨骼肌纤维的前体)所产生的力，结合电刺激和对硅胶衬底上皱纹的分析。现有的方法依赖于肌肉质量或某些蛋白质的表达，两者与肌肉力量的相关性都不强。肌管强度的精确测量为治疗肌肉萎缩提供了更有效的药物靶点筛选。肌肉萎缩，即肌肉组织的退化，会对生活质量产生毁灭性的影响，已知会影响寿命。这种影响在老龄化人群中表现得尤为明显

  来源：Scientific Reports

  时间：2022-09-06

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