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Nature Cell Biology:RNA结合蛋白靶标研究新方法LACE-seq
2021年6月10日凌晨,中国科学院生物物理研究所薛愿超课题组及其合作者在《Nature Cell Biology》杂志上在线发表了题为"Global profiling of RNA-binding protein target sites by LACE-seq"的技术报告论文。 人类基因组编码了约1500个RNA结合蛋白(RNA-binding protein, RBP),它们往往通过结合RNA分子上的特定基序或结构元件而调控细胞内各种RNA分子的加工、定位、翻译和稳定性等。研究表明,RBP在早期生殖、个体发育、细胞分化、增殖和凋亡等几乎所有的生理过程中都发挥了
来源:中国科学院生物物理研究所
时间:2021-06-11
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新冠病毒变异太快了,试管技术可在新变种出现之前模拟病毒变异
病毒的变种,例如引起COVID-19的病毒,现在可以在实验室里迅速研究,甚至在它们出现在自然界并成为一个重大的公共卫生挑战之前。昆士兰大学、Qimr Brgffor医学研究所、多尔蒂感染和免疫研究所、莫纳什大学和昆士兰健康发展了一种综合控制病毒的技术,允许快速分析和映射新的潜在病毒变体。UQ的首席研究员Alexander Khromykh教授说,这项技术非常适合在COVID-19等全球大流行期间使用。Khromykh教授说:“这项技术应该使我们能够回答有关潜在病毒变体是否对某种药物或疫苗敏感的问题,甚至在它们出现在自然界之前。”“到目前为止,我们对病毒变异的出现大多只是等待和反应,
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多年研究,获昼夜节律基因突破性进展
这种内在的驱动力促使你晚上去睡觉,早上醒来去吃饭、工作和娱乐,这是遗传的,而且不仅仅是人类。几乎每一个生物体——从动物到植物,以及几种微生物和真菌——都有一个内部的生物钟,或昼夜节律。然而,科学家们一直困惑于这些基因是如何运作的。现在,弗吉尼亚理工大学的科学家们借助老鼠的DNA、培养皿和耐心,离答案又近了一步。在一项新的研究发表在《基因与发展,Shihoko小岛,生物科学学系的助理教授,弗吉尼亚理工大学理学院的一部分,和Fralin生命科学研究所的研究员,和她的团队发现了一个新基因,Per2AS,控制睡眠/唤醒周期的老鼠。Per2AS是一种新型的非
来源:Genes & Development
时间:2021-06-10
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RNA二级结构测序新技术解析Dicer结合与切割底物的RNA结构基础
RNA结构是RNA的调控与功能的基础。过去科学家们使用X-ray晶体衍射、NMR、冷冻电镜等生物物理的手段,解析了许多RNA三维结构,揭示了RNA发挥不同功能的结构基础。随着二代测序技术的发展,研究者结合化学修饰与高通量测序开发了许多高通量探测全转录组RNA二级结构的技术,并应用于RNA结构与RNA相关调控的功能研究中,揭示出RNA结构在转录后调控中的广泛作用。张强锋课题组一直致力于RNA结构的研究,将RNA结构探测技术应用于不同亚细胞空间定位 (Sun et al., 2019)、早期胚胎发育不同时期 (Shi et al., 2020)RNA结构图谱的刻画以及寨卡病毒 (Li et a
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Nature子刊:一种无需在最开始就加入,无需重建生物分子的荧光标记新技术
一种使用锰复合物的新技术可以有效地标记CD8+ t细胞。图片来源:Nikolaos Kaplaneris生物分子调节每个活细胞内的生物功能。如果科学家能够理解分子机制,那么就有可能检测出严重的功能障碍。在分子水平上,这可以通过将荧光标记来实现。最新一项研究现在能够证明锰的复合物能更加方便地标记某些生物分子。在过去,这是通过在生物分子中加入一个标记,从一开始就完全重建生物分子来实现的,这需要大量的步骤。但是这种方法不仅需要大量的时间和资源,而且还会产生不必要的废物。现在爱丁堡大学的研究人员已经证明,一种普通金属锰的无毒复合物可以在合成的最后一分钟方便地标记一类特殊
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通过空间和时间追踪RNA的新方法
图:单细胞斑马鱼胚胎:MDC研究实验室在这个发育的早期阶段发现了许多局部基因。它们的大部分遗传信息流入后一种细胞的前体细胞…资料来源:AG Junker, MDC“生命的奇迹”最开始是最明显的:受精卵细胞通过沟槽分裂成卵泡,包裹在羊膜囊中,展开形成胚层。当卵裂球开始分化成不同的细胞时——当它们最终发育成一个完整的有机体时。简·菲利普·容克博士说:“我们想知道不同细胞之间的后期差异是否已经部分地与受精卵细胞相连。”他是Helmholtz协会(MDC) Max Delbrück分子医学中心柏林系统生物学研究所(BIMSB)数量发育生物学实验室的负责人。
来源:Nature Communications
时间:2021-06-09
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《科学》临床前研究提出了降低老年人COVID-19死亡率的新方法
明尼阿波利斯/圣。保罗(06/08/2021)——明尼苏达大学医学院和梅奥诊所的同事们的一项新研究揭示了一种可能的新方法,可以防止感染SARS-CoV-2的老年人死亡和严重疾病。研究人员在一项临床前研究中证明,老年小鼠感染与SARS-CoV-2密切相关的乙型冠状病毒后,衰老溶解药物显著降低了死亡率。这项发表在《科学》杂志上的研究是由Laura Niedernhofer医学博士、哲学博士和Paul Robbins博士共同领导的,他们都是密歇根大学医学院生物化学、分子生物学和生物物理学系的教授,也是衰老和新陈代谢生物学研究所的联合主任,以及Sara Hamilton博士,检验医学和病理学系助理教授
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Nature新突破:全新IgM抗体能更有效地对抗新冠病毒
德克萨斯大学等机构的研究人员近日开发出一种全新的IgM抗体疗法,比传统的IgG抗体疗法的中和效力高于230多倍。这种IgM抗体也能有效中和多个病毒变种。这项题为“Nasal delivery of an IgM offers broad protection from SARS-CoV-2 variants”的研究发表在本周的《Nature》杂志上。研究人员改造了IgM抗体,发现在所有情况下,这些抗体在中和COVID-19病毒方面明显比标准IgG抗体更有效。其中,一种名为IgM-14的抗体显示出对原始毒株和新兴变种(比如当前在英国、南非和巴西发现的须关注变种)的效力显著增强。此外,在鼻腔给药时
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研究人员开发了一种测量大脑健康的新方法
你的大脑和你的实际年龄相比有多大?根据发表在《阿尔茨海默氏症》杂志上的研究结果,拉什大学医学中心的研究人员开发的一种新的大脑健康测量方法,可能为识别有记忆和思维问题风险的个体提供了一种新的方法;痴呆症:6月1日发表在阿尔茨海默病协会杂志上。研究人员称之为“认知时钟”,该工具是一种基于认知表现的大脑健康测量工具。它可能在将来被用来预测随着年龄增长而出现记忆和思维问题的可能性。“老年痴呆症是痴呆症最常见的病因之一,其他脑部疾病随着年龄的增长会慢慢积累。年龄被广泛认为是阿尔茨海默病的主要危险因素,但这是一个非常不完善的预测因素,因为并不是每个人都会随着年龄的增长而发展成痴呆症,”拉什阿尔茨海默病中心
来源:Rush University Medical Center
时间:2021-06-07
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新发现为早期BRCA突变相关乳腺癌提供了更好的治疗方法
本周公布了一种新的治疗方法的结果,这种方法有可能改善遗传性BRCA突变和高危早期乳腺癌患者的预后。这些结果首次表明,一种阻止癌细胞修复DNA的药物(称为PARP抑制剂)能够显著降低高危患者在完成标准化疗后乳腺癌复发的风险,手术和放射治疗。题为“BRCA1或BRCA2突变乳腺癌患者的辅助奥拉帕利,这篇论文发表在6月3日出版的《新英格兰医学杂志》上,并将于6月6日作为第一篇摘要在2021年美国临床肿瘤学协会(ASCO)年会的全体会议上发表。主要作者兼奥林匹亚试验指导委员会主席安德鲁·图特,医学博士。,伦敦国王学院癌症研究所的首席研究员是在美国以外的患者中进行的部分研究,并将在ASCO上展示研究结果
来源:Houston Methodist
时间:2021-06-07
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双管齐下!治疗地中海贫血的新方法
费城儿童医院的研究人员开发出一种治疗血液疾病(比如镰状细胞病和β-地中海贫血)的概念验证疗法,这种疗法可以通过激活胎儿和成人血红蛋白的产生来提高血红蛋白水平。研究人员利用一种病毒载体来重新激活胎儿血红蛋白的产生,抑制突变血红蛋白,并提供功能性的成人血红蛋白。这项研究结果于近日发表在《Haematologica》杂志上。资深作者Stefano Rivella博士说:“到目前为止,研究人员一直通过两种方法来治疗镰状细胞病或β-地中海贫血等血液疾病:一是增加成人血红蛋白基因的功能拷贝,二是增加胎儿血红蛋白的产生。在这项研究中,我们同时开展了这两项研究,为这些患者产生更多的血红蛋白提供了机会。”镰状细
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Webinar邀请 | 高通量qPCR技术助力抗生素抗性基因研究专题分享会
新冠疫情爆发以来,环境中微生物对公共卫生安全的潜在影响受到广泛关注。在临床与农业生产中,均存在抗生素过量使用现象。由此也引出了一个被日渐重视的问题——抗生素耐药菌。从第一种商品化合成抗菌药“百浪多息”面世以来,经过漫长的发展,目前已有上百种可供使用的抗生素类型。而另一方面,得到鉴定的耐药基因(Antimicrobial resistance genes,ARGs)也达到了数千种。对各类型样本中不同耐药基因序列开展研究与评估,需要更加高效的高通量技术进行应对。此外,在复杂的环境背景下,各类微生物也在不断地发展出新的ARGs,所以对于高通量技术也要求具备更好的灵活性,以应对持续地增加新目标基因,以
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选择更好的避孕方法可以预防乳腺癌
图像:导管内注射正常人类乳腺上皮细胞的小鼠乳腺的荧光立体显微图像。资料来源:玛丽·沙姆塞丁(EPFL)。激素避孕,如口服避孕药,和阴道环,含有人工合成的激素避孕通过停止排卵,改变宫颈粘液阻止精子通过宫颈和找到一个鸡蛋,或改变子宫的衬里防止受精卵植入。尽管激素避孕药被广泛使用,但众所周知,它会增加乳腺癌的风险,而乳腺癌是全球妇女与癌症相关的死亡的最常见原因,也是2020年最常见的诊断癌症名单上的首位。激素避孕药的主要成分是黄体酮,它与女性的性激素黄体酮相似。孕激素参与许多生物过程,包括月经周期、怀孕和胎儿发育的各个方面,如大脑编程。现在,一个由欧洲医
来源:EMBO Molecular Medicine
时间:2021-06-02
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牛津纳米孔技术公司超长DNA测序试剂盒
Oxford Nanopore Technologies发布了新的超长DNA测序试剂盒,用于与Circulomics的Nanobind试剂盒结合使用。这种基于转座的试剂盒最大限度地提高了超长读长的数量,能够对单个DNA片段进行长达4.2 Mb的连续测序。每个PromethIon流细胞可以获得超过100个超过1mb的读取。立即索取Apogee超灵敏纳米流式细胞仪的更多资料
来源:genomeweb
时间:2021-06-02
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铁蛋白多聚抗原-抗体检测自身免疫病新方法
自身免疫疾病是机体针对自身抗原产生大量自身抗体后引起的慢性全身性疾病。因此,检测患者体内特异性的自身抗体是诊断该病的主要指标。例如,用ELISA检测原发性干燥综合征(Primary Sjogren's syndrome, pSS)患者血清中的抗M3及α-fodrin抗体,为其诊断提供了重要参考。然而,目前存在的问题是M3及α-fodrin短肽检测其抗体的敏感度较低,临床存在漏诊现象。 为了提高自身免疫疾病的诊断效率,中国科学院生物物理研究所阎锡蕴院士团队与北京大学人民医院栗占国教授团队合作,以pSS为研究模型发展了一种基于铁蛋白展示多聚抗原和多聚二抗检测自身抗体的新方法,使其检测
来源:中国科学院生物物理研究所
时间:2021-06-01
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一种创新性液体活检技术利用表观遗传特征检测儿童肿瘤
科学家分析了血液中循环的肿瘤DNA的短片段。这种液体活检分析利用了骨肿瘤独特的表观遗传学原理,并且不依赖于任何遗传改变,而这种改变在儿童期癌症中很少见。这种方法有望改善个性化诊断,并可能改善诸如尤因肉瘤等儿童肿瘤的未来治疗方法。该研究已发表在Nature Communications杂志上。由圣安娜儿童癌症研究所(St. Anna CCRI)的科学家与奥地利科学院CeMM分子医学研究中心合作进行的一项研究为儿童肿瘤的“液体活检”分析提供了一种创新方法。这种方法利用了肿瘤泄漏到血流中的小DNA片段的片段化模式,揭示了许多儿童期癌症的独特的表观遗传学特征。包括尤文氏肉瘤在内的儿童和青少年骨肿瘤,临
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Science子刊:利用单细胞技术分析疫苗接种后,抗体如何产生
由葡萄牙医学研究所和里斯本大学医学院教授LuísGraça领导进行的一项研究分析了淋巴结,扁桃体和血液,发现了控制抗体产生的细胞如何形成及起作用的。这一成果公布在Science Immunology杂志上,揭示了调节抗体生产的关键所在,对于抗体生产失调的疾病(例如自身免疫性疾病或过敏)具有重要意义。在过去的几个月中,我们见证了疫苗诱导的抗体针对诸如COVID-19等感染的保护作用的重要性。但是,研究接种疫苗后抗体产生的人类细胞非常困难,因为该过程发生在淋巴结而不是血液中。为了研究这一过程,有必要使用新兴技术对每个单细胞中的基因进行测序和鉴定。 “要了解这项技术的强大功能,我们必须
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牛津大学:SARS-CoV-2 RNA新发现,开启了新的潜在治疗方法
一个由牛津大学、格拉斯哥大学和海德堡大学的研究人员领导的国际多学科研究小组发现了SARS-CoV-2 RNA与宿主细胞的相互作用,其中许多是感染的基础。这些发现为开发具有广泛抗病毒潜力的COVID-19新的治疗策略铺平了道路。SARS-CoV-2的遗传信息编码在RNA分子而不是DNA中。这种RNA必须被增殖、翻译和包装成新的病毒颗粒才能产生病毒后代。尽管这些过程很复杂,SARS-CoV-2只编码少数能够与病毒RNA结合的蛋白质。为了规避这一限制,SARS-CoV-2劫持了细胞蛋白,并将其重新用于自身利益。然而,到目前为止,这些蛋白质的身份仍然是未知的。牛津大学的研究人员与英国和欧洲的其他实验室
来源:University of Oxford
时间:2021-05-31
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阻滞人类受精卵分裂的致病基因CHEK1突变和潜在治疗方法
清华新闻网5月11日电 不孕不育问题影响着全球数百万的育龄夫妇。国家卫生健康委员会2018年6月发布的《2017年我国卫生健康事业发展统计公报》显示,中国育龄夫妇的不孕不育率为12%-15%左右,不孕者约5000万。受环境污染、生育年龄推迟、生活压力等因素影响,不孕人数还在不断增加,影响家庭健康幸福,并给国民经济发展带来隐患。造成不孕症的因素错综复杂,包括生殖细胞发育、运输及受精卵着床或发育异常等。部分不孕症可以通过体外受精(IVF)和单精子注射(ICSI)等辅助生殖手段解决,而另一部分原因造成的不孕症,如遗传因素造成的不孕症目前还无法解决,研究其机制及潜在的治疗手段对提高家庭健康和人口质量至
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Nature子刊:单细胞精细脂质组学技术
5月17日,清华大学精密仪器系质谱研究团队发文报道基于质谱的单细胞脂质组精细结构表征技术,实现了哺乳动物单细胞内脂质的大规模精细结构分析,解决了单细胞质谱领域长期面临的关键技术挑战。基于单细胞内多种类型脂质异构体的鉴定与相对定量,该团队实现了野生型非小细胞肺癌(HCC827)细胞群体中耐药细胞的精准识别,对癌症的精准诊疗具有重要意义。随着人口老龄化和生活方式的转变,癌症已经成为威胁人类健康的主要因素。近年来,面向癌症的个体化、精准治疗蓬勃发展,而实现癌症精准治疗的关键在于根据癌症发生的部位、临床病理、基因突变和免疫特性等全面、准确对癌症进行分类,并评估组织中癌细胞的异质性。单细胞分析是研究细胞