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富士胶片欧文生物技术新公司成立 开启本土生物制药培养基定制服务
作为富士胶片欧文科技在华本土化发展的重要一步,富士胶片欧文生物技术(苏州)有限公司(下文为“富士欧文生物”)于11月19日在苏州高新区正式注册成功。 12月1日,富士胶片(中国)投资有限公司总经理田中健一先生、富士胶片欧文生物技术(苏州)有限公司总经理品川涉先生、苏州高新区党工委副书记/虎丘区代区长宋长宝、苏州高新区党工委委员/管委会副主任虞美华、苏州高新区党工委委员/科技城管委会主任卢潮线上参与了新公司的授牌仪式。苏州授牌仪式现场 卢潮 (左,苏州高新区党工委委员/科技城管委会主任)、是雄(右,富士胶片(中国)投资有限公司-欧文科技事业部) 新公司成立后,将新设立创新合作中心(Inn
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复旦大学王久存、金力团队研发预测我国平原地区居民高原习服能力的复合表型分析方法
2021年2月22日,《表型组学》(Phenomics)期刊首期以封面论文形式在线发表了复旦大学生命科学学院及人类表型组研究院王久存教授和金力院士团队的最新研究成果。该团队自主研发了应用复合表型策略的分析方法,通过对人体复合生理表型指标的分析,可有效预测我国平原人群在高原习服慢性期的血氧饱和度变化,进而发现个体的高原习服能力与习服慢性期血氧饱和度呈显著相关。此外,研究团队指出,该复合表型分析方法可以作为一种通用的研究手段与策略对生命健康领域的复杂问题开展研究。 高原习服表型研究具有重要科研意义与应用前景 高原习服,是指平原世居者进入高原或高原世居者进入更高海拔地区的过程中,在高原低氧
来源:复旦大学人类表型组研究院
时间:2021-12-02
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倪挺教授课题组开发新型单细胞聚类和批次效应矫正网络分析方法
单细胞RNA-seq技术可揭示细胞间异质性,发现新的功能亚群,解析细胞谱系分化,发现疾病新标志物等,具有重要价值并成为遗传学研究的重要前沿。2021年2月22日,分子生物学领域国际知名期刊Nucleic Acids Research在线发表了复旦大学生命科学学院及人类表型组研究院倪挺课题组题为“Independent component analysis based gene co-expression network inference (ICAnet) to decipher functional modules for better single-cell clustering a
来源:复旦大学人类表型组研究院
时间:2021-12-02
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《自然·生物技术》刊发国际组学数据质量控制联盟最新研究成果
美国东部时间2021年9月9日上午11:00,国际权威学术期刊《自然·生物技术》(Nature Biotechnology)在线发表了5篇最新科研论文,专题发布了国际组学数据质量控制联盟第四期(MAQC-IV,亦为“测序质量控制第二期SEQC2”)的最新研究成果。 该项目由美国食品药品监督管理局(FDA)牵头,历时5年多,聚集了来自全球100多个单位的300多位科学家参与。通过建立和使用一系列基因组参考物质,国际组学数据质量控制联盟对众多新一代测序平台和生物信息学方法在体细胞和胚系突变、拷贝数变异、肿瘤靶向测序和液态活检、单细胞测序等多个应用场景的性能进行了系统研究。复旦大学人类表型组
来源:复旦大学人类表型组研究院
时间:2021-12-02
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顾宏周团队开发利用环化酶高效制备DNA单环和拓扑结构的新技术
环状单链脱氧核糖核酸(circular ssDNA)在分子生物和DNA纳米技术等领域扮演着重要的角色,如作为滚环扩增的必备模板、DNA拓扑结构的构成单元等。目前常用的依赖于T4 DNA连接酶制备环状单链DNA的方法容易产生多聚体副产物,导致单体环产率低;而现有的基于CircLigase(一种单链环化酶)制备环状单链DNA的方法虽然可一定程度上减少副产物,但是随着底物DNA链长度的增大,CircLigase催化成环的效率急剧下降。因此,高效率地制备单链环形DNA仍是一个亟待解决的问题。 2020年12月31日,我院顾宏周团队在Analytical Chemistry杂志发表
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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顾宏周课题组《Chem》报道利用DNA核酶开发高效制备单链DNA纳米结构的新方法
近15年来,作为构建DNA纳米组装体的主要方法之一,DNA折纸术(DNA origami)可使得一条长单链DNA在成百或千条短链DNA的辅助下, 通过碱基互补配对原则折叠并锁定生成所设计的纳米图案,它的出现极大地推动了DNA纳米技术领域的发展。单链DNA折纸术(single-stranded DNA origami)是传统DNA折纸术的一种进化和衍生,它摒除了对众多短序列的需求,通过高度集成序列信息于一条长单链DNA中, 实现了单个DNA序列的自我折叠和组装体构建(类似于蛋白质由一条长肽链折叠成三维结构)。 单链DNA组装体(ssDNs)的可编程性和可寻址性均能与传统的多
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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突破!徐彦辉团队《Science》长文揭示转录起始复合物识别启动子及动态组装的分子机制
以人类为代表的高等生物,进化出复杂的基因表达调控机制,利用同一套基因组遗传信息,分化出数百种不同的细胞类型,以适应对复杂生长发育过程的需要。转录起始过程发生在几万种不同基因的高度多样化的启动子区。围绕这些启动子区,人体细胞产生极其复杂和精细的调控,如染色质重塑复合物BAF/PBAF剔除核小体暴露出启动子DNA使转录发生,组蛋白修饰和DNA甲基化修饰动态调控转录因子和转录共激活因子招募,3D基因组背景下的增强子和启动子环化,及近期备受关注的液液相分离等。上述过程的综合结果都是导致抑制或不同程度的促进转录起始复合物在启动子区的组装及后续的转录激活,实现基因差异性表达,决定细胞的表型和发
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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又一突破!徐彦辉团队《Science》长文揭示完整转录起始超级复合物结构与功能
发生在基因启动子区的转录起始过程是基因表达调控的核心,决定着细胞的命运,影响众多生理病理过程。以RNA聚合酶II(Pol II)为核心的转录前起始复合物(preinitiation complex,PIC),识别几乎所有编码基因和大部分非编码基因的启动子区,响应各种转录调控信号,起始基因转录。在今年4月初,我院徐彦辉团队在Science杂志报道了包含TFIID的转录前起始复合物结构,揭示了启动子识别及PIC装配的动态过程,该工作一经发表就得到了国内外广大同行的高度认可。 在上世纪90年代,科学家们发现一个功能非常重要的转录共激活因子,命名为中介体(Mediator)。Me
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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顾宏周课题组《Chem》全面评述由DNA酶推动的 DNA 纳米技术应用的最新进展
DNA是由脱氧核糖核苷酸组成的大分子聚合物,具备较好的稳定性和可编程性,已被广泛作为一种通用型生物材料用于构建各式各样具有精确尺寸和特定形状的纳米结构。另一方面,自上世纪90年代以来,生化学家发现DNA像RNA和蛋白质一样具备酶活性,可催化一系列化学反应,包括在特定位点切割DNA或RNA。当结构和酶这两种不同类型的DNA相遇时产生了一系列火花,一些新的研究领域有望因此而诞生。经典的DNA 纳米结构与具有切割DNA活性的脱氧核酶的比较。A. DNA 折纸形成稳定的矩形结构; B. 具有茎-环-茎结构的脱氧核酶在辅因子帮助下水解切割破坏DNA。 2021年9月3日,我院顾宏
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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胡晋川/钱茂祥课题组《Nucleic Acids Research 》合作开发单碱基分辨率DNA氧化损伤测序方法
生命活动需要氧化反应提供能量,这一过程同时会产生活性氧物质(ROS)。ROS能诱导多种DNA氧化损伤,其中最常见的是8-oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine (OG),被视为氧化压力的标志物。如果没有被及时修复,OG可能引起G→T突变,与多种癌症、神经退行性疾病和衰老相关。除此之外,OG也有类似于表观遗传修饰的作用,可以通过几种不同的方式调控基因表达,例如OG的修复中间体apurinic (AP) site可以通过促进和稳定富含G碱基的DNA二级结构G四链体(G-quadruplexes, G4)来影响转录。&nb
来源:复旦大学生物医学研究院
时间:2021-12-02
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徐书华团队发展新方法ArchaicSeeker 2.0重塑史前人类基因交流与演化模型
2021年10月29日,《自然-通讯》(Nature Communications)在线发表了复旦大学生命科学学院徐书华团队的研究成果“Refining models of archaic admixture in Eurasia with ArchaicSeeker2.0”。该项工作提出了一种基于隐马尔科夫模型(Hidden Markov Model)的计算分析新方法ArchaicSeeker 2.0。相比于之前的方法,新方法能更有效地检测和量化近缘种的基因交流并在更精细的尺度上重构复杂的基因交流历史;该方法也适用于非人类物种的遗传数据分析。研究团队应用新方法分析了公共开放数据库中的人群基因
来源:复旦大学生命科学学院
时间:2021-12-02
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我院杨萍技术团队在脂质组与菌群互作下的TMAO循环、中药绞股蓝皂苷干预脑疾病机制研究方面取得新进展
三甲胺-N-氧化物(TMAO)是一种内源性小分子,存在于外周循环,与心血管疾病密切相关。近几年研究发现TMAO在人脑脊液中存在,且患有认知障碍患者脑内TMAO水平高于正常人,但具体起源尚不清楚。中药绞股蓝Gynostemma pentaphyllum (Thunb.) Makino主要成分绞股蓝皂苷不仅具有保护心血管、降血脂、抗肿瘤、抗衰老以及增强人体免疫力等功效,研究发现其有利于改善AD小鼠的空间学习记忆能力和空间记忆保持能力。我院杨萍正高级实验师技术团队的研究通过建立体外酶孵育体系和小鼠高胆碱模型,解析了肠道菌群、FMO3酶、
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又一突破!徐彦辉团队《Science》揭示完整转录起始超级复合物结构与功能
发生在基因启动子区的转录起始过程是基因表达调控的核心,决定着细胞的命运,影响众多生理病理过程。以RNA聚合酶II(Pol II)为核心的转录前起始复合物(preinitiation complex,PIC),识别几乎所有编码基因和大部分非编码基因的启动子区,响应各种转录调控信号,起始基因转录。在今年4月初,徐彦辉研究员团队在Science杂志报道了包含TFIID的转录前起始复合物结构,揭示了启动子识别及PIC装配的动态过程,该工作一经发表就得到了国内外广大同行的高度认可。 在上世纪90年代,科学家们发现一个功能非常重要的转录共激活因子,命名
来源:复旦大学遗传工程国家重点实验室
时间:2021-12-02
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马明团队在天然药用功能分子生物合成领域取得重要突破
近日,北京大学药学院、天然药物及仿生药物国家重点实验室马明研究员团队连续在美国化学会ACS Catalysis学术期刊、英国皇家化学会Chemical Science上发表科研论文,报道其研究团队在天然药用功能分子的生物合成领域取得的系列成果。 1、环肽分子生物合成-发现第一个催化异构化/环化双功能硫酯酶并解析其晶体结构 2021年9月7日,马明研究团队在美国化学会ACS Catalysis上发表了题为“Functional characterization and crystal structure of the bifunctional
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王晓月团队开发基于单碱基编辑的高通量方法鉴定肿瘤变异功能
2021年3月10日,中国医学科学院基础医学研究所王晓月团队在Genome Biology发表了“Identification of pathogenic variants in cancer genes using base editing screens with editing efficiency correction”的论文。研究以单碱基编辑工具为基础,开发出一种可以高效研究核苷酸变异功能的高通量筛选方法。 复杂疾病相关变异的功能鉴定一直是遗传学研究中的重要问题。肿瘤患者中含有大量的核苷酸变异,包括遗传性变异和体细胞变异,这些变异的致病性判断对肿瘤的风
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中国医学科学院医药生物技术研究所李珂团队发现三阴性乳腺癌治疗新靶点
2021年3月24日,中国医学科学院医药生物技术研究所、药物研究所等合作单位在Science Translational Medicine封面发表了“Faciogenital Dysplasia 5 supports cancer stem cell traits in basal-like breast cancer by enhancing EGFR stability”的论文。研究报道了FGD5(Rho鸟苷酸交换因子家族成员,Faciogenital Dysplasia 5)通过加强EGFR(表皮生长因子受体,Epidermal growth factor r
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双机制降解剂研究新突破 | 清华大学药学院饶燏团队在《Cell Research》发表新型双机制降解剂在淋巴瘤治疗中的应用研究
2021年8月20日,清华大学药学院饶燏团队在《Cell Research》杂志上发表了题为“Merging PROTAC and molecular glue for degrading BTK and GSPT1 proteins concurrently”的研究论文,该工作报道了一类新型的双机制降解剂,该降解剂既能够以PROTAC方式靶向BTK,同时也以分子胶的方式降解GSPT1,与单靶降解剂或抑制剂相比,这种双机制降解剂实现了更高效的DLBCL和AML肿瘤细胞增殖抑制效果,为DLBCL和AML治疗提供新型治疗方案。 靶向
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阿尔茨海默氏症领域新突破 |清华大学药学院鲁白团队开发出全球首个全面模拟人类阿尔茨海默症的大鼠模型
很少有疾病能比阿尔茨海默氏症(AD),更能引起人们的恐惧和无奈。在过去的一个多世纪,研究人员已经开展了400多项AD药物临床试验,但迄今为止尚无一个治本(阻止疾病进程)的药物可用。究其原因,很重要的一条是AD动物模型不能模拟人类AD病人的真实情况;从而导致有很多候选药物在动物模型中有效,但在AD病人的临床试验中则无效。 在过去的25年,科学家们相继建立了200多个AD动物模型,但这些模型或者没有神经细胞的死亡,或者缺乏完整的病理特征。由于设计或技术方面的缺陷,迄今未能获得一个真正能够全面反映人类AD病理表型和疾病机制的动物模型,这在很大程度上妨碍了对
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缩小肺癌治疗差距的新方法
医学博士罗伯特·范·哈伦说,新的研究表明,外科医生应该为目前吸烟的患者提供肺癌手术。照片/Colleen Kelley/辛辛那提大学肺癌是美国最致命的癌症,但其影响在不同种族和民族群体中并不平均。医学博士罗伯特·范·哈伦表示,与白人患者相比,非裔美国人、西班牙裔美国人、美国印第安人和多种族患者患肺癌的几率更高,总体生存率更低,接受手术的可能性更小。这些差异背后的许多因素需要持续的研究,不可能在一夜之间得到解决,但Van Haren和他辛辛那提大学的同事们发现了一个可以立即做出的实际改变。在发表在《心胸外科与心血管外科杂志》上的一项新
来源:Journal of Thoracic and Cardiovascular Surgery
时间:2021-11-30
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新技术能更好地评估人群对病毒的暴露程度
准确评估某一人群接触某一特定病毒的情况是困难的,因为这样做的工具没有考虑到许多病毒包含多种传播毒株,或人们可以接种疫苗或自然免疫等因素。宾夕法尼亚州立大学(Penn State)领导的一个研究小组以流感为模型,开发了一种新技术,克服了许多这些障碍,他们表示,该工具可能有助于更好地评估接触各种病毒的情况,包括导致COVID-19和肺炎的病毒。领导这项研究的生物学副教授Maciej Boni说:“没有对人群接触特定病毒的准确图像,我们就无法有效地规划和实施公共卫生干预措施。”在11月18日发表在《自然通讯》(Nature Communications)杂志上的研究中,研究人员专门调查了热带地区甲型
来源:Nature Communications
时间:2021-11-30