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测序中的关键,PacBio专家分享样本制备的技巧与方法
也许,您是在大学的生物课上学会了如何提取DNA。不过,当您开展更多高风险的实验时,您可能会发现提取DNA进行测序可不仅仅是裂解、沉淀、洗涤、重悬那么简单。在此,PacBio的专家介绍了一些DNA提取的技巧和方法,可帮助您更轻松地分离DNA。为了获得最佳的结果来推动生物学发现,样本制备是测序项目中的关键步骤。在使用长读长测序技术时,包括HiFi测序,您不仅希望DNA没有缺口和降解,还希望得到长片段(几十kb)以实现梦寐以求的长读取。瑞典乌普萨拉大学SciLifeLab的长读长测序专家Olga Pettersson建议,(样本制备的)目标是获得尽可能长、尽可能纯以及尽可能新鲜的分子。”#1挑战:样
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几十年研究,更好的预防儿童呼吸道感染的新方法
抗病毒肽是由三个螺旋状物(绿色)组成的,它们锁住了病毒的融合蛋白(橙色),防止病毒进入细胞。通过设计一小块蛋白质或肽,可以防止人类副流感病毒(HPIVs)附着在细胞上,研究人员改进了啮齿动物模型中的一种方法,旨在帮助保持儿童健康。人类副流感病毒,是儿童呼吸道感染的主要原因,大约造成30%到40%的如肝炎和肺炎等疾病的元凶。这些病毒还会影响老年人和免疫系统受损的人。对于患病的人,HPIV必须附着在细胞上,并注入它们的遗传物质,以开始制造新的病毒。HPIV3是这些病毒中最流行的。目前还没有批准的用于人感染HPIV3的疫苗或抗病毒药物。实验室领导的一项研
来源:Journal of the American Chemical Society
时间:2021-05-12
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【报名倒计时1周 】终版议程 | 第七届中国先进分子诊断技术与应用论坛优惠门票限时抢!
2021年5月20-21日,将在上海新发展亚太JW万豪酒店举办的MDx 2021第七届中国先进分子诊断技术与应用论坛完整议程精彩亮相,诚挚邀请行业精英齐聚一堂,共探感染诊断新格局!5月18日下午5点正式关闭报名通道,详情请咨询组委会。倒计时1周注册特惠:注册满2赠1 满3赠2扫码进入官网领取优惠门票MDx2021全新议程第一天5月20日|周四* 议程以现场为准,详情可至MDx2021官网查看第二天5月21日|周五* 议程以现场为准,详情可至MDx2021官网查看倒计时1周限时特惠抢购满2赠1 满3赠2进入官网报名抢订优惠席位↓感谢以下
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新的CAR-T方法清除脑癌肿瘤
澳大利亚的科学家报告说,他们在临床前模型中使用嵌合抗原受体(CAR) T细胞治疗清除脑癌肿瘤。该团队在《临床和转化免疫学》杂志上发表了他们的研究(“新型高亲和力EGFRvIII特异性嵌合抗原受体T细胞有效消除人类胶质母细胞瘤”),他们相信其免疫治疗设计的方法可以为胶质母细胞瘤患者的新治疗铺平道路。“嵌合抗原受体(CAR) T细胞治疗血液系统恶性肿瘤的日益成功,使其在许多其他癌症类型的应用重新焕发活力,并重新关注其在实体肿瘤中的应用。我们提出了一种针对恶性胶质母细胞瘤(一种侵袭性恶性胶质瘤)的新型CAR - t,存活率低,治疗方案十多年来一直没有改变,”研究者写道。“我们使用Myrio治疗公司的
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新的绘图技术揭示了癌症的表观遗传驱动因素
科学家们通过识别导致这种疾病的基因突变,在了解和开发多种癌症治疗方法方面取得了重大进展。现在,一个由威尔康奈尔医学院、纽约长老会医院和纽约基因组中心(NYGC)的研究人员领导的团队开发了一种机器学习技术,用于检测具有类似效果的其他DNA修改。这项研究于5月10日发表在美国癌症研究协会(American Association for Cancer Research)的期刊《癌症发现》(Cancer Discovery)上,重点关注DNA的一种化学修饰,即甲基化,这种修饰通常会使附近的基因沉默。这项新技术可以分析在肿瘤细胞中检测到的数千种DNA甲基化变化,并推断哪些变化可能推动了肿瘤的生长。甲基
来源:Cancer Discovery
时间:2021-05-12
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突破血脑屏障,南大等发现凋亡小体在药物递送中的作用
南京大学和澳门大学的研究人员近日发现,纳米级凋亡小体(AB)可作为一种新型的脑靶向药物载体,为帕金森氏症和其他脑疾病带来了新的希望。血脑屏障(BBB)是限制性最强的屏障,可阻止大多数生物分子和药物进入大脑,为脑血管疾病的治疗设置了障碍。随着老龄化问题的日益严重,脑部疾病的治疗面临着严峻的挑战,因此迫切需要有效的脑部药物递送策略。凋亡小体是从濒死的细胞中分泌出来的,尽管已经发现了半个世纪,但它们的作用被低估。凋亡小体的大小分布不均匀(从数百纳米到数千纳米不等),且成分复杂(尤其是含有大的染色体DNA片段和各种细胞质蛋白),因此很少用于药物递送。然而,由于具有天然的生物活性脂质和丰富的蛋白质,凋亡
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化疗的突破:PARP抑制剂缩小突变胰腺癌患者的肿瘤
Kim Reiss博士费城——超过三分之二的携带基因突变的胰腺癌患者,在从强化化疗转向PARP抑制剂rucaparib作为维持治疗后,他们的肿瘤停止生长或大幅萎缩。宾夕法尼亚大学艾布拉姆森癌症中心的研究人员今天在《临床肿瘤学杂志》上在线报道。来自ACC II期试验的结果支持使用rucaparib治疗胰腺癌患者的BRCA1, BRCA2和PALB2变体,以帮助控制肿瘤生长,而不产生化疗的积极副作用。Rucaparib是一种靶向药物,目前已被美国食品药品监督管理局批准作为复发性卵巢癌、输卵管癌和前列腺癌的维持治疗药物,但不包括胰腺癌。“对于P
来源:Penn Medicine
时间:2021-05-11
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通往治疗脑肿瘤的钥匙--突破血脑屏障
乔治亚理工学院机械工程博士生Yutong Guo(左)和她的导师、助理教授Costas Arvanitis,开发了一种使用超声波治疗脑部疾病的方法。基于RNA的药物有可能改变许多疾病的治疗标准,使个性化医疗成为现实。这种迅速扩大的治疗方法具有成本效益,相当容易制造,并且能够到达以前没有药物到达的地方,达到以前不可用药的途径。到目前为止,这些有希望的药物在进入保护良好的大脑治疗肿瘤或其他疾病方面还不是很有用。现在,一个由乔治亚理工学院和埃默里大学的Costas Arvanitis领导的多机构研究团队找到了一种方法:利用超声波和携带RNA的纳米颗粒穿过
来源:Science Advances
时间:2021-05-10
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PNAS:新方法识别健康身体结构中的Tau聚集体
并非所有tau蛋白的积累都是有害的,来自宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院的一组研究人员开发了一种方法来证明这一点。利用哺乳动物细胞模型,研究人员将高分辨率显微镜与机器学习相结合,表明当tau蛋白作为身体正常生理的一部分时,实际上会形成小的聚集物。通过这一点,他们可以区分在健康条件下发生的聚集物和与神经系统疾病相关的聚集物,这可能为筛选治疗方法打开大门,这些治疗方法可能会分解有害的聚集物。这项研究发表在《美国国家科学院院刊》上。该研究的资深作者,生理学副教授Melike Lakadamyali博士说:“没有很多工具可以可视化细胞内微小的、病理的
来源:Penn Medicine
时间:2021-05-10
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3D生物打印技术让人造细胞具有了方向感
生物制造的多室水凝胶纤维形成多尺度的仿生结构。3D生物打印技术可以制造出模仿自然组织的工程支架。为了再生应用,控制这些工程支架中的细胞组织是一个复杂而富有挑战性的过程。细胞组织在空间分布和排列上趋向于高度有序,因此用于组织工程应用的生物工程细胞支架必须非常接近这种取向,才能像自然组织一样发挥作用。在《应用物理评论》(Applied Physics Reviews)杂志上,一个国际研究团队描述了他们通过一种称为多室生物打印的方法,在沉积的水凝胶纤维中指导细胞取向。该团队使用静态混合来制造条纹水凝胶纤维,这些纤维是由不同水凝胶的微丝填充而成的。在这种结
来源:Applied Physics Reviews
时间:2021-05-08
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革命性技术——四周“长出”鼻软骨!
阿尔伯塔大学的一个研究小组发现了一种利用三维生物打印技术制作定制形状软骨的方法,可用于外科手术。这项工作的目的是让外科医生更容易安全地恢复患有鼻软骨缺损的皮肤癌患者手术后的特征。研究人员使用了一种特殊设计的水凝胶——一种类似果冻的材料——可以与从患者身上采集的细胞混合,然后以特定的形状打印出来通过三维成像。经过几周的时间,这种材料在实验室里被培养成功能性软骨。“在个体身上制造软骨需要一辈子的时间,而我们的新方法大约需要四周。所以你还是希望它会有一定程度的成熟,尤其是植入体内的时候。但在功能上,它可以做软骨做的事情,”医学院外科教授AdetolaAdesida说。“它必须有一定的机械性能和强度。
来源:University of Alberta Faculty of Medicine & Dentistry
时间:2021-05-07
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测序新技术高效检测罕见突变并降低测序错误
液体活检等技术让研究人员能够利用新一代测序(NGS)的力量,以无创方式从血液样本中鉴定出基因突变,从而更早地诊断癌症。然而,NGS也有其自身的缺陷,因为高错误率在NGS技术中很常见,这往往限制了其临床应用。如今,约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员开发出一种名为SaferSeqS(更安全测序系统)的新技术,以纠正测序的低效和错误。近日,研究小组在《Nature Biotechnology》杂志上发表了他们的新技术。新的SaferSeqS技术能够高效检测血液中的罕见突变,并将评估血液中突变的现有方法的错误率降低100倍。文章的第一作者Joshua Cohen表示,一小部分癌细胞将其DN
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麻省在对抗癌症方面的研究取得了突破
图像:pac相对于其他疗法的优势。资料来源:S. Thai Thayumanavan阿默斯特,质量。麻省大学阿默斯特应用生命科学研究所生物活性传递中心的一组研究人员设计了一种有可能彻底改变疾病治疗,包括癌症治疗的纳米颗粒。这项新研究发表在今天的《Angewandte Chemie》杂志上,它结合了两种不同的方法,更精确、更有效地治疗受癌症影响的特定细胞。两种最有前途的新疗法涉及通过生物制剂或抗体-药物偶联物(adc)传递抗癌药物。每一种都有其优点和局限性。以蛋白质为基础的药物等生物制剂可以直接替代细胞中出现故障的蛋白质。因此,与传统化疗相比,它们的
来源:Antimicrobial Agents and Chemotherapy
时间:2021-05-07
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压力会导致脱发吗?5种逆转伤害的方法
压力是对精神或情绪压力的自然反应,它会导致心理健康不佳以及一些身体症状,如胸痛、头痛、肌肉痛、胃病和性问题,但它会导致脱发吗?Express.co.uk与专家毛发学家Stephanie Sey交谈了解情况。对于某些人,在过去的一年里,无数次的禁闭是一个很好的机会来缓解压力。与朋友的通勤和固定的计划已经被更多的时间在家和爱人一起取代。呆在家里鼓励了一些人多锻炼,吃得更健康,睡得更香,减少了压力。随着封锁的放松和不远处没有限制的承诺,我们都在为生活做好准备,让压力回到我们的生活中。除了心理健康不佳之外,压力还会导致情绪波动、坏习惯和一些轻微的身体症状等一系列问题。但是压力会导致脱发吗?Stepha
来源:today news post
时间:2021-05-07
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解决肥胖的方法可能就在你的肠道里
对于肥胖的流行没有简单的解决办法。有一些资源、项目和指南是为了帮助人们通过健康的饮食和有规律的体育活动过上健康的生活方式。现在,一项新的研究显示,一种胃特异性蛋白质在肥胖的发展过程中发挥着关键作用,可能会导致治疗方法的发展,帮助那些正在努力实现和维持减肥的人。这项名为“Gastrokine-1, an anti-amyloidogenic protein secreted by the stomach, regulates diet-induced obesity”的研究发表在《科学报告》杂志上,由印第安纳大学医学院微生物学和免疫学副教授大卫·布恩博士领导,还是圣母大学生物系的兼职教授。研究人
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抗生素抗性基因研究与高通量qPCR技术
发现和使用抗生素,是二十世纪医疗领域两大重要突破。抗生素的使用显著降低了人类发病率和死亡率。同时,抗生素与其他抗菌剂在农业领域也有广泛应用,如畜牧业,水产养殖等。抗生素可以破坏细菌细胞壁、阻碍DNA、RNA或蛋白质的合成,抑制细菌的代谢生长。面对抗生素,细菌也有应对的办法,如阻止抗生素渗透细胞壁、表达出外排系统加速抗生素排除到细胞外[1-3]。此外,研究也发现,细菌可以通过接合、转导、或转化等途径吸收外源DNA,获得抗生素抗性基因(ARGs)[4, 5]。在此基础上,进一步的研究发现移动遗传元件(MGE),如质粒、转座元件、整合子等,在细菌抗性基因转移中发挥着重要作用[6, 7]。这些遗传元件
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《自然-方法》发表脑智卓越中心关于新型RNA编辑工具开发及其优化的研究成果
CRISPR/Cas13是一类RNA介导的靶向RNA切割的系统,它被广泛地应用于RNA敲低、RNA单碱基编辑、RNA定点修饰、RNA活细胞示踪以及核酸检测领域。相比于传统的RNA干扰技术,Cas13系统具有更高的敲低效率和特异性;相比于Cas9介导的DNA编辑技术,Cas13不会对基因组造成永久性改变,甚至可以通过药物来调控RNA编辑,使其具有可逆性,因此在疾病治疗上具有比较独特的优势。2015年,美国Eugene Koonin实验室和张锋团队合作,利用计算生物学方法在微生物宏基因组数据库中发现了Cas13a(c2c2),Cas13b(c2c6)和Cas13c(c2c7)三种系统,并证
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Annu. Rev. Immunol. |张泽民组综述单细胞技术..
肿瘤微环境具有高度异质性,深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征,对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来,单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器,在相关研究中取得了一系列突破进展,包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。近日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)、生命科学联合中心(CLS)张泽民教授受邀在免疫学顶级综述期刊Annual Reviews of Immunology上发表了题为Insights Gained from Sin
来源:北京大学前沿交叉学科研究院
时间:2021-05-04
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新的抗体检测方法可预测重度COVID-19病例
截至2021年4月,全世界约有280万人死于COVID-19。在流感大流行的早期,研究人员开发了准确的诊断测试,并确定了与更糟糕的结果相关的健康状况。然而,一个临床预测谁面临着住院、使用呼吸机或死于该病的最高风险的方法仍然遥不可及,研究人员描述了一种两步预后测试,可以帮助预测患者对SARS-CoV-2感染的反应。该测试结合了疾病危险因素评分和感染早期产生抗体的测试。研究人员说,它可以在诊断时使用,以帮助在最严重的症状出现之前指导治疗选择。化学生物学家格雷戈里·韦斯(Gregory Weiss)博士实验室的研究生艾米莉·桑德斯(Emily Sanders)说:“你可以非常敏感地预测某人将患上严重
来源:American Society for Microbiology
时间:2021-05-04
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朱瑞、龚旗煌等综述钙钛矿光伏技术在空间环境中的应用
近期,由北京大学物理学院“极端光学创新研究团队”朱瑞研究员、龚旗煌院士与西北工业大学涂用广副教授、黄维院士,中国科学院空天信息创新研究院徐国宁研究员组成的三校(院)联合研究团队,系统总结了钙钛矿光伏电池在空间环境多种极端因素(包括电子辐射、质子辐射、紫外线辐照、伽玛射线辐射、高真空光照、高低温循环等)下的稳定性情况以及空间飞行试验任务,并讨论了钙钛矿光伏电池面向空间应用的挑战及展望。相关成果以“Perovskite Solar Cells for Space Applications: Progress and Challenges”为题发表在国际学术期刊Advanced Ma